Protein–RNA interactions for Protein: Q969S8

HDAC10, Histone deacetylase 10, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC10Q969S8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC10Q969S8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC10Q969S8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC10Q969S8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC10Q969S8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC10Q969S8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC10Q969S8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC10Q969S8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC10Q969S8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC10Q969S8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC10Q969S8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC10Q969S8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC10Q969S8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC10Q969S8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC10Q969S8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC10Q969S8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC10Q969S8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC10Q969S8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC10Q969S8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC10Q969S8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC10Q969S8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC10Q969S8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC10Q969S8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC10Q969S8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC10Q969S8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC10Q969S8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC10Q969S8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC10Q969S8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC10Q969S8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC10Q969S8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC10Q969S8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC10Q969S8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC10Q969S8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC10Q969S8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC10Q969S8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC10Q969S8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC10Q969S8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC10Q969S8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC10Q969S8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC10Q969S8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC10Q969S8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC10Q969S8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC10Q969S8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC10Q969S8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC10Q969S8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC10Q969S8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC10Q969S8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC10Q969S8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC10Q969S8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC10Q969S8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC10Q969S8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
HDAC10Q969S8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC10Q969S8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC10Q969S8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC10Q969S8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC10Q969S8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC10Q969S8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC10Q969S8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC10Q969S8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC10Q969S8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC10Q969S8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC10Q969S8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC10Q969S8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC10Q969S8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC10Q969S8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC10Q969S8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC10Q969S8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC10Q969S8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC10Q969S8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC10Q969S8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC10Q969S8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC10Q969S8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC10Q969S8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC10Q969S8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC10Q969S8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC10Q969S8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC10Q969S8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC10Q969S8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC10Q969S8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC10Q969S8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC10Q969S8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC10Q969S8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC10Q969S8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC10Q969S8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC10Q969S8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC10Q969S8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC10Q969S8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC10Q969S8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC10Q969S8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC10Q969S8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC10Q969S8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC10Q969S8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC10Q969S8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC10Q969S8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC10Q969S8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC10Q969S8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC10Q969S8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC10Q969S8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC10Q969S8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC10Q969S8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms