Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCAMP4Q969E2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCAMP4Q969E2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCAMP4Q969E2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCAMP4Q969E2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SCAMP4Q969E2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCAMP4Q969E2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCAMP4Q969E2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCAMP4Q969E2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCAMP4Q969E2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCAMP4Q969E2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCAMP4Q969E2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCAMP4Q969E2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCAMP4Q969E2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCAMP4Q969E2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCAMP4Q969E2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCAMP4Q969E2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCAMP4Q969E2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCAMP4Q969E2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCAMP4Q969E2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCAMP4Q969E2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCAMP4Q969E2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SCAMP4Q969E2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCAMP4Q969E2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCAMP4Q969E2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCAMP4Q969E2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCAMP4Q969E2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCAMP4Q969E2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCAMP4Q969E2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCAMP4Q969E2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCAMP4Q969E2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCAMP4Q969E2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SCAMP4Q969E2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCAMP4Q969E2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCAMP4Q969E2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCAMP4Q969E2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SCAMP4Q969E2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCAMP4Q969E2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCAMP4Q969E2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCAMP4Q969E2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCAMP4Q969E2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCAMP4Q969E2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCAMP4Q969E2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCAMP4Q969E2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCAMP4Q969E2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCAMP4Q969E2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCAMP4Q969E2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCAMP4Q969E2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAMP4Q969E2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAMP4Q969E2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAMP4Q969E2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAMP4Q969E2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAMP4Q969E2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAMP4Q969E2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAMP4Q969E2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAMP4Q969E2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAMP4Q969E2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAMP4Q969E2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAMP4Q969E2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAMP4Q969E2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAMP4Q969E2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCAMP4Q969E2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCAMP4Q969E2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCAMP4Q969E2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCAMP4Q969E2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCAMP4Q969E2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SCAMP4Q969E2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SCAMP4Q969E2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SCAMP4Q969E2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCAMP4Q969E2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCAMP4Q969E2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCAMP4Q969E2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCAMP4Q969E2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCAMP4Q969E2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCAMP4Q969E2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCAMP4Q969E2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SCAMP4Q969E2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCAMP4Q969E2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCAMP4Q969E2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAMP4Q969E2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAMP4Q969E2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAMP4Q969E2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAMP4Q969E2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAMP4Q969E2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAMP4Q969E2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAMP4Q969E2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAMP4Q969E2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAMP4Q969E2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAMP4Q969E2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAMP4Q969E2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAMP4Q969E2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAMP4Q969E2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAMP4Q969E2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAMP4Q969E2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAMP4Q969E2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAMP4Q969E2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCAMP4Q969E2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAMP4Q969E2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAMP4Q969E2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCAMP4Q969E2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms