Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
PRG4Q92954 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
PRG4Q92954 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
PRG4Q92954 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
PRG4Q92954 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC36■■■■□ 3.35
PRG4Q92954 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
PRG4Q92954 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC36■■■■□ 3.35
PRG4Q92954 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
PRG4Q92954 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
PRG4Q92954 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
PRG4Q92954 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
PRG4Q92954 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
PRG4Q92954 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
PRG4Q92954 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
PRG4Q92954 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
PRG4Q92954 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
PRG4Q92954 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
PRG4Q92954 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
PRG4Q92954 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
PRG4Q92954 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
PRG4Q92954 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
PRG4Q92954 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
PRG4Q92954 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
PRG4Q92954 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
PRG4Q92954 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
PRG4Q92954 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC35.97■■■■□ 3.35
PRG4Q92954 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
PRG4Q92954 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC35.96■■■■□ 3.35
PRG4Q92954 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
PRG4Q92954 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
PRG4Q92954 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC35.95■■■■□ 3.35
PRG4Q92954 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
PRG4Q92954 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
PRG4Q92954 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
PRG4Q92954 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
PRG4Q92954 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
PRG4Q92954 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
PRG4Q92954 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
PRG4Q92954 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
PRG4Q92954 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
PRG4Q92954 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
PRG4Q92954 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
PRG4Q92954 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
PRG4Q92954 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
PRG4Q92954 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
PRG4Q92954 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
PRG4Q92954 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
PRG4Q92954 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
PRG4Q92954 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
PRG4Q92954 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
PRG4Q92954 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
PRG4Q92954 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
PRG4Q92954 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
PRG4Q92954 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
PRG4Q92954 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
PRG4Q92954 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
PRG4Q92954 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
PRG4Q92954 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
PRG4Q92954 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
PRG4Q92954 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
PRG4Q92954 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
PRG4Q92954 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
PRG4Q92954 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
PRG4Q92954 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
PRG4Q92954 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
PRG4Q92954 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
PRG4Q92954 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
PRG4Q92954 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
PRG4Q92954 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
PRG4Q92954 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
PRG4Q92954 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
PRG4Q92954 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
PRG4Q92954 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
PRG4Q92954 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
PRG4Q92954 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
PRG4Q92954 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
PRG4Q92954 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
PRG4Q92954 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
PRG4Q92954 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
PRG4Q92954 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
PRG4Q92954 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
PRG4Q92954 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC35.9■■■■□ 3.34
PRG4Q92954 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
PRG4Q92954 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
PRG4Q92954 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
PRG4Q92954 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC35.89■■■■□ 3.34
PRG4Q92954 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
PRG4Q92954 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
PRG4Q92954 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.34
PRG4Q92954 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
PRG4Q92954 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
PRG4Q92954 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
PRG4Q92954 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
PRG4Q92954 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
PRG4Q92954 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
PRG4Q92954 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
PRG4Q92954 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
PRG4Q92954 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
PRG4Q92954 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
PRG4Q92954 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms