Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TAF4BQ92750 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TAF4BQ92750 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TAF4BQ92750 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TAF4BQ92750 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TAF4BQ92750 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TAF4BQ92750 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TAF4BQ92750 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TAF4BQ92750 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TAF4BQ92750 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TAF4BQ92750 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TAF4BQ92750 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TAF4BQ92750 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TAF4BQ92750 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TAF4BQ92750 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TAF4BQ92750 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TAF4BQ92750 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TAF4BQ92750 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TAF4BQ92750 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TAF4BQ92750 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TAF4BQ92750 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TAF4BQ92750 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TAF4BQ92750 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TAF4BQ92750 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TAF4BQ92750 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TAF4BQ92750 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TAF4BQ92750 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TAF4BQ92750 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TAF4BQ92750 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TAF4BQ92750 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAF4BQ92750 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAF4BQ92750 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAF4BQ92750 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAF4BQ92750 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAF4BQ92750 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAF4BQ92750 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAF4BQ92750 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAF4BQ92750 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TAF4BQ92750 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAF4BQ92750 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAF4BQ92750 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAF4BQ92750 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAF4BQ92750 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAF4BQ92750 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAF4BQ92750 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAF4BQ92750 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAF4BQ92750 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAF4BQ92750 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAF4BQ92750 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAF4BQ92750 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAF4BQ92750 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAF4BQ92750 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TAF4BQ92750 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAF4BQ92750 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TAF4BQ92750 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAF4BQ92750 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAF4BQ92750 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAF4BQ92750 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TAF4BQ92750 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TAF4BQ92750 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TAF4BQ92750 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TAF4BQ92750 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TAF4BQ92750 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TAF4BQ92750 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TAF4BQ92750 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TAF4BQ92750 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAF4BQ92750 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAF4BQ92750 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAF4BQ92750 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAF4BQ92750 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAF4BQ92750 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAF4BQ92750 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAF4BQ92750 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAF4BQ92750 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAF4BQ92750 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAF4BQ92750 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAF4BQ92750 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAF4BQ92750 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAF4BQ92750 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAF4BQ92750 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF4BQ92750 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF4BQ92750 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF4BQ92750 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF4BQ92750 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF4BQ92750 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF4BQ92750 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF4BQ92750 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF4BQ92750 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF4BQ92750 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF4BQ92750 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TAF4BQ92750 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TAF4BQ92750 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TAF4BQ92750 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TAF4BQ92750 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TAF4BQ92750 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TAF4BQ92750 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF4BQ92750 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF4BQ92750 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF4BQ92750 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF4BQ92750 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms