Protein–RNA interactions for Protein: Q92520

FAM3C, Protein FAM3C, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3CQ92520 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM3CQ92520 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM3CQ92520 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM3CQ92520 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM3CQ92520 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM3CQ92520 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM3CQ92520 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM3CQ92520 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM3CQ92520 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM3CQ92520 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM3CQ92520 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM3CQ92520 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM3CQ92520 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM3CQ92520 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM3CQ92520 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM3CQ92520 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM3CQ92520 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM3CQ92520 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM3CQ92520 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM3CQ92520 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM3CQ92520 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM3CQ92520 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM3CQ92520 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM3CQ92520 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM3CQ92520 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM3CQ92520 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM3CQ92520 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM3CQ92520 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM3CQ92520 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM3CQ92520 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM3CQ92520 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM3CQ92520 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM3CQ92520 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM3CQ92520 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM3CQ92520 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM3CQ92520 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM3CQ92520 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM3CQ92520 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM3CQ92520 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM3CQ92520 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM3CQ92520 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM3CQ92520 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM3CQ92520 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM3CQ92520 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM3CQ92520 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM3CQ92520 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM3CQ92520 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM3CQ92520 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM3CQ92520 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM3CQ92520 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM3CQ92520 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM3CQ92520 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM3CQ92520 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM3CQ92520 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM3CQ92520 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM3CQ92520 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM3CQ92520 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM3CQ92520 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM3CQ92520 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM3CQ92520 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM3CQ92520 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM3CQ92520 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM3CQ92520 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM3CQ92520 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM3CQ92520 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM3CQ92520 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM3CQ92520 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM3CQ92520 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM3CQ92520 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM3CQ92520 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM3CQ92520 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM3CQ92520 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM3CQ92520 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM3CQ92520 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM3CQ92520 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM3CQ92520 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM3CQ92520 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM3CQ92520 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM3CQ92520 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM3CQ92520 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM3CQ92520 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM3CQ92520 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM3CQ92520 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM3CQ92520 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM3CQ92520 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM3CQ92520 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM3CQ92520 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM3CQ92520 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM3CQ92520 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM3CQ92520 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM3CQ92520 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM3CQ92520 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM3CQ92520 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM3CQ92520 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM3CQ92520 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM3CQ92520 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM3CQ92520 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM3CQ92520 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM3CQ92520 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM3CQ92520 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms