Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HERVK_113Q902F9 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HERVK_113Q902F9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HERVK_113Q902F9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HERVK_113Q902F9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HERVK_113Q902F9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HERVK_113Q902F9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HERVK_113Q902F9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HERVK_113Q902F9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HERVK_113Q902F9 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HERVK_113Q902F9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HERVK_113Q902F9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HERVK_113Q902F9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HERVK_113Q902F9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HERVK_113Q902F9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HERVK_113Q902F9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HERVK_113Q902F9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HERVK_113Q902F9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HERVK_113Q902F9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HERVK_113Q902F9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HERVK_113Q902F9 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HERVK_113Q902F9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HERVK_113Q902F9 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HERVK_113Q902F9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HERVK_113Q902F9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HERVK_113Q902F9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HERVK_113Q902F9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HERVK_113Q902F9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HERVK_113Q902F9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HERVK_113Q902F9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HERVK_113Q902F9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HERVK_113Q902F9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HERVK_113Q902F9 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HERVK_113Q902F9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HERVK_113Q902F9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HERVK_113Q902F9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HERVK_113Q902F9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HERVK_113Q902F9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HERVK_113Q902F9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HERVK_113Q902F9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HERVK_113Q902F9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HERVK_113Q902F9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HERVK_113Q902F9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HERVK_113Q902F9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HERVK_113Q902F9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HERVK_113Q902F9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HERVK_113Q902F9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HERVK_113Q902F9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HERVK_113Q902F9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HERVK_113Q902F9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HERVK_113Q902F9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HERVK_113Q902F9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HERVK_113Q902F9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HERVK_113Q902F9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HERVK_113Q902F9 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HERVK_113Q902F9 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HERVK_113Q902F9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HERVK_113Q902F9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HERVK_113Q902F9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HERVK_113Q902F9 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HERVK_113Q902F9 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HERVK_113Q902F9 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HERVK_113Q902F9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HERVK_113Q902F9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HERVK_113Q902F9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HERVK_113Q902F9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HERVK_113Q902F9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HERVK_113Q902F9 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HERVK_113Q902F9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HERVK_113Q902F9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HERVK_113Q902F9 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HERVK_113Q902F9 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HERVK_113Q902F9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HERVK_113Q902F9 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HERVK_113Q902F9 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HERVK_113Q902F9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HERVK_113Q902F9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HERVK_113Q902F9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HERVK_113Q902F9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HERVK_113Q902F9 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HERVK_113Q902F9 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HERVK_113Q902F9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HERVK_113Q902F9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HERVK_113Q902F9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HERVK_113Q902F9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HERVK_113Q902F9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HERVK_113Q902F9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HERVK_113Q902F9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HERVK_113Q902F9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HERVK_113Q902F9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HERVK_113Q902F9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HERVK_113Q902F9 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HERVK_113Q902F9 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HERVK_113Q902F9 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HERVK_113Q902F9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HERVK_113Q902F9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HERVK_113Q902F9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HERVK_113Q902F9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HERVK_113Q902F9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HERVK_113Q902F9 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms