Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF1

PSPC1, Paraspeckle component 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1Q8WXF1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSPC1Q8WXF1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSPC1Q8WXF1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSPC1Q8WXF1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSPC1Q8WXF1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSPC1Q8WXF1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSPC1Q8WXF1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSPC1Q8WXF1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PSPC1Q8WXF1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSPC1Q8WXF1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSPC1Q8WXF1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSPC1Q8WXF1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSPC1Q8WXF1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSPC1Q8WXF1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSPC1Q8WXF1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSPC1Q8WXF1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSPC1Q8WXF1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSPC1Q8WXF1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSPC1Q8WXF1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSPC1Q8WXF1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSPC1Q8WXF1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSPC1Q8WXF1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSPC1Q8WXF1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSPC1Q8WXF1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSPC1Q8WXF1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSPC1Q8WXF1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSPC1Q8WXF1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSPC1Q8WXF1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSPC1Q8WXF1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSPC1Q8WXF1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSPC1Q8WXF1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSPC1Q8WXF1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSPC1Q8WXF1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSPC1Q8WXF1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSPC1Q8WXF1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSPC1Q8WXF1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSPC1Q8WXF1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSPC1Q8WXF1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSPC1Q8WXF1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSPC1Q8WXF1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSPC1Q8WXF1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSPC1Q8WXF1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSPC1Q8WXF1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSPC1Q8WXF1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSPC1Q8WXF1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PSPC1Q8WXF1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PSPC1Q8WXF1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSPC1Q8WXF1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSPC1Q8WXF1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSPC1Q8WXF1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PSPC1Q8WXF1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSPC1Q8WXF1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSPC1Q8WXF1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSPC1Q8WXF1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSPC1Q8WXF1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSPC1Q8WXF1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSPC1Q8WXF1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSPC1Q8WXF1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSPC1Q8WXF1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSPC1Q8WXF1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSPC1Q8WXF1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSPC1Q8WXF1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSPC1Q8WXF1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSPC1Q8WXF1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSPC1Q8WXF1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSPC1Q8WXF1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSPC1Q8WXF1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSPC1Q8WXF1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSPC1Q8WXF1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSPC1Q8WXF1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSPC1Q8WXF1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PSPC1Q8WXF1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSPC1Q8WXF1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSPC1Q8WXF1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSPC1Q8WXF1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSPC1Q8WXF1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSPC1Q8WXF1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSPC1Q8WXF1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSPC1Q8WXF1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSPC1Q8WXF1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSPC1Q8WXF1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSPC1Q8WXF1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSPC1Q8WXF1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSPC1Q8WXF1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSPC1Q8WXF1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSPC1Q8WXF1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSPC1Q8WXF1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSPC1Q8WXF1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PSPC1Q8WXF1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PSPC1Q8WXF1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PSPC1Q8WXF1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSPC1Q8WXF1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSPC1Q8WXF1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSPC1Q8WXF1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSPC1Q8WXF1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSPC1Q8WXF1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSPC1Q8WXF1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSPC1Q8WXF1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSPC1Q8WXF1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSPC1Q8WXF1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
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