Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COPS9Q8WXC6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COPS9Q8WXC6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
COPS9Q8WXC6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
COPS9Q8WXC6 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
COPS9Q8WXC6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COPS9Q8WXC6 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COPS9Q8WXC6 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COPS9Q8WXC6 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
COPS9Q8WXC6 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
COPS9Q8WXC6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COPS9Q8WXC6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COPS9Q8WXC6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COPS9Q8WXC6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COPS9Q8WXC6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COPS9Q8WXC6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COPS9Q8WXC6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COPS9Q8WXC6 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
COPS9Q8WXC6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COPS9Q8WXC6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COPS9Q8WXC6 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COPS9Q8WXC6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COPS9Q8WXC6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
COPS9Q8WXC6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COPS9Q8WXC6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COPS9Q8WXC6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COPS9Q8WXC6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
COPS9Q8WXC6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COPS9Q8WXC6 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COPS9Q8WXC6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COPS9Q8WXC6 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COPS9Q8WXC6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
COPS9Q8WXC6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
COPS9Q8WXC6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
COPS9Q8WXC6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COPS9Q8WXC6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COPS9Q8WXC6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC15.03■□□□□ -0
COPS9Q8WXC6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COPS9Q8WXC6 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COPS9Q8WXC6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COPS9Q8WXC6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COPS9Q8WXC6 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COPS9Q8WXC6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COPS9Q8WXC6 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COPS9Q8WXC6 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COPS9Q8WXC6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COPS9Q8WXC6 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COPS9Q8WXC6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
COPS9Q8WXC6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COPS9Q8WXC6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COPS9Q8WXC6 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.02■□□□□ -0
COPS9Q8WXC6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COPS9Q8WXC6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COPS9Q8WXC6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
COPS9Q8WXC6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
COPS9Q8WXC6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
COPS9Q8WXC6 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
COPS9Q8WXC6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
COPS9Q8WXC6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
COPS9Q8WXC6 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
COPS9Q8WXC6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
COPS9Q8WXC6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
COPS9Q8WXC6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
COPS9Q8WXC6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
COPS9Q8WXC6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
COPS9Q8WXC6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
COPS9Q8WXC6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
COPS9Q8WXC6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
COPS9Q8WXC6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
COPS9Q8WXC6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
COPS9Q8WXC6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
COPS9Q8WXC6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
COPS9Q8WXC6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
COPS9Q8WXC6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
COPS9Q8WXC6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
COPS9Q8WXC6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
COPS9Q8WXC6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COPS9Q8WXC6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
COPS9Q8WXC6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COPS9Q8WXC6 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
COPS9Q8WXC6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COPS9Q8WXC6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COPS9Q8WXC6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COPS9Q8WXC6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
COPS9Q8WXC6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COPS9Q8WXC6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COPS9Q8WXC6 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
COPS9Q8WXC6 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COPS9Q8WXC6 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COPS9Q8WXC6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COPS9Q8WXC6 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COPS9Q8WXC6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
COPS9Q8WXC6 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
COPS9Q8WXC6 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COPS9Q8WXC6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
COPS9Q8WXC6 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS9Q8WXC6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS9Q8WXC6 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS9Q8WXC6 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS9Q8WXC6 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms