Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWX9

SELENOM, Selenoprotein M, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOMQ8WWX9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SELENOMQ8WWX9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SELENOMQ8WWX9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SELENOMQ8WWX9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SELENOMQ8WWX9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SELENOMQ8WWX9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SELENOMQ8WWX9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SELENOMQ8WWX9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SELENOMQ8WWX9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SELENOMQ8WWX9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SELENOMQ8WWX9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SELENOMQ8WWX9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SELENOMQ8WWX9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SELENOMQ8WWX9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SELENOMQ8WWX9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SELENOMQ8WWX9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SELENOMQ8WWX9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SELENOMQ8WWX9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SELENOMQ8WWX9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SELENOMQ8WWX9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SELENOMQ8WWX9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SELENOMQ8WWX9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SELENOMQ8WWX9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SELENOMQ8WWX9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SELENOMQ8WWX9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SELENOMQ8WWX9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SELENOMQ8WWX9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SELENOMQ8WWX9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SELENOMQ8WWX9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SELENOMQ8WWX9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SELENOMQ8WWX9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SELENOMQ8WWX9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SELENOMQ8WWX9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SELENOMQ8WWX9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SELENOMQ8WWX9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SELENOMQ8WWX9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SELENOMQ8WWX9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SELENOMQ8WWX9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SELENOMQ8WWX9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SELENOMQ8WWX9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SELENOMQ8WWX9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SELENOMQ8WWX9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SELENOMQ8WWX9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SELENOMQ8WWX9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SELENOMQ8WWX9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SELENOMQ8WWX9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SELENOMQ8WWX9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SELENOMQ8WWX9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SELENOMQ8WWX9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SELENOMQ8WWX9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SELENOMQ8WWX9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SELENOMQ8WWX9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SELENOMQ8WWX9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SELENOMQ8WWX9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SELENOMQ8WWX9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SELENOMQ8WWX9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SELENOMQ8WWX9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SELENOMQ8WWX9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SELENOMQ8WWX9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SELENOMQ8WWX9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SELENOMQ8WWX9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SELENOMQ8WWX9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SELENOMQ8WWX9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SELENOMQ8WWX9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SELENOMQ8WWX9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SELENOMQ8WWX9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SELENOMQ8WWX9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SELENOMQ8WWX9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SELENOMQ8WWX9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SELENOMQ8WWX9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SELENOMQ8WWX9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SELENOMQ8WWX9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SELENOMQ8WWX9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SELENOMQ8WWX9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SELENOMQ8WWX9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SELENOMQ8WWX9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SELENOMQ8WWX9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SELENOMQ8WWX9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SELENOMQ8WWX9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SELENOMQ8WWX9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SELENOMQ8WWX9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SELENOMQ8WWX9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SELENOMQ8WWX9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SELENOMQ8WWX9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SELENOMQ8WWX9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SELENOMQ8WWX9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SELENOMQ8WWX9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SELENOMQ8WWX9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SELENOMQ8WWX9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SELENOMQ8WWX9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SELENOMQ8WWX9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SELENOMQ8WWX9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SELENOMQ8WWX9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SELENOMQ8WWX9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SELENOMQ8WWX9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SELENOMQ8WWX9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SELENOMQ8WWX9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SELENOMQ8WWX9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SELENOMQ8WWX9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SELENOMQ8WWX9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms