Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVR3

C7orf43, Uncharacterized protein C7orf43, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C7orf43Q8WVR3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
C7orf43Q8WVR3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
C7orf43Q8WVR3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
C7orf43Q8WVR3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
C7orf43Q8WVR3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
C7orf43Q8WVR3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
C7orf43Q8WVR3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
C7orf43Q8WVR3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
C7orf43Q8WVR3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
C7orf43Q8WVR3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
C7orf43Q8WVR3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
C7orf43Q8WVR3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
C7orf43Q8WVR3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
C7orf43Q8WVR3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
C7orf43Q8WVR3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
C7orf43Q8WVR3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
C7orf43Q8WVR3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
C7orf43Q8WVR3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
C7orf43Q8WVR3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
C7orf43Q8WVR3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
C7orf43Q8WVR3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
C7orf43Q8WVR3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
C7orf43Q8WVR3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
C7orf43Q8WVR3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
C7orf43Q8WVR3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
C7orf43Q8WVR3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
C7orf43Q8WVR3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
C7orf43Q8WVR3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
C7orf43Q8WVR3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
C7orf43Q8WVR3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
C7orf43Q8WVR3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
C7orf43Q8WVR3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
C7orf43Q8WVR3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
C7orf43Q8WVR3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
C7orf43Q8WVR3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
C7orf43Q8WVR3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
C7orf43Q8WVR3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
C7orf43Q8WVR3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
C7orf43Q8WVR3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
C7orf43Q8WVR3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
C7orf43Q8WVR3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
C7orf43Q8WVR3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
C7orf43Q8WVR3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
C7orf43Q8WVR3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
C7orf43Q8WVR3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
C7orf43Q8WVR3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
C7orf43Q8WVR3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
C7orf43Q8WVR3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
C7orf43Q8WVR3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
C7orf43Q8WVR3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
C7orf43Q8WVR3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
C7orf43Q8WVR3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
C7orf43Q8WVR3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
C7orf43Q8WVR3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
C7orf43Q8WVR3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
C7orf43Q8WVR3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
C7orf43Q8WVR3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
C7orf43Q8WVR3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
C7orf43Q8WVR3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
C7orf43Q8WVR3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
C7orf43Q8WVR3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
C7orf43Q8WVR3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
C7orf43Q8WVR3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
C7orf43Q8WVR3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
C7orf43Q8WVR3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
C7orf43Q8WVR3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
C7orf43Q8WVR3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
C7orf43Q8WVR3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
C7orf43Q8WVR3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
C7orf43Q8WVR3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
C7orf43Q8WVR3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
C7orf43Q8WVR3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
C7orf43Q8WVR3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
C7orf43Q8WVR3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
C7orf43Q8WVR3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
C7orf43Q8WVR3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
C7orf43Q8WVR3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
C7orf43Q8WVR3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
C7orf43Q8WVR3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
C7orf43Q8WVR3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
C7orf43Q8WVR3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
C7orf43Q8WVR3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
C7orf43Q8WVR3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
C7orf43Q8WVR3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
C7orf43Q8WVR3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
C7orf43Q8WVR3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
C7orf43Q8WVR3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
C7orf43Q8WVR3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
C7orf43Q8WVR3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
C7orf43Q8WVR3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
C7orf43Q8WVR3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
C7orf43Q8WVR3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
C7orf43Q8WVR3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
C7orf43Q8WVR3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
C7orf43Q8WVR3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
C7orf43Q8WVR3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
C7orf43Q8WVR3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
C7orf43Q8WVR3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
C7orf43Q8WVR3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
C7orf43Q8WVR3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms