Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC107Q8WV48 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC107Q8WV48 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC107Q8WV48 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC107Q8WV48 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC107Q8WV48 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC107Q8WV48 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC107Q8WV48 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC107Q8WV48 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC107Q8WV48 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC107Q8WV48 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC107Q8WV48 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC107Q8WV48 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC107Q8WV48 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC107Q8WV48 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC107Q8WV48 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC107Q8WV48 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC107Q8WV48 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC107Q8WV48 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC107Q8WV48 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC107Q8WV48 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC107Q8WV48 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC107Q8WV48 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC107Q8WV48 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC107Q8WV48 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC107Q8WV48 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC107Q8WV48 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC107Q8WV48 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC107Q8WV48 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC107Q8WV48 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC107Q8WV48 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC107Q8WV48 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC107Q8WV48 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC107Q8WV48 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC107Q8WV48 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC107Q8WV48 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC107Q8WV48 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC107Q8WV48 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC107Q8WV48 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC107Q8WV48 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC107Q8WV48 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC107Q8WV48 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC107Q8WV48 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC107Q8WV48 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC107Q8WV48 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC107Q8WV48 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC107Q8WV48 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC107Q8WV48 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC107Q8WV48 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC107Q8WV48 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC107Q8WV48 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC107Q8WV48 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC107Q8WV48 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC107Q8WV48 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC107Q8WV48 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC107Q8WV48 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC107Q8WV48 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC107Q8WV48 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC107Q8WV48 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC107Q8WV48 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC107Q8WV48 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC107Q8WV48 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC107Q8WV48 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC107Q8WV48 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC107Q8WV48 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC107Q8WV48 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC107Q8WV48 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC107Q8WV48 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC107Q8WV48 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC107Q8WV48 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC107Q8WV48 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC107Q8WV48 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC107Q8WV48 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC107Q8WV48 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC107Q8WV48 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC107Q8WV48 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC107Q8WV48 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC107Q8WV48 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC107Q8WV48 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC107Q8WV48 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC107Q8WV48 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC107Q8WV48 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC107Q8WV48 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC107Q8WV48 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC107Q8WV48 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC107Q8WV48 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC107Q8WV48 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC107Q8WV48 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC107Q8WV48 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC107Q8WV48 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC107Q8WV48 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC107Q8WV48 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC107Q8WV48 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC107Q8WV48 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC107Q8WV48 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC107Q8WV48 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC107Q8WV48 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC107Q8WV48 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC107Q8WV48 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC107Q8WV48 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms