Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF30

WHAMM, WASP homolog-associated protein with actin, membranes and microtubules, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WHAMMQ8TF30 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
WHAMMQ8TF30 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
WHAMMQ8TF30 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
WHAMMQ8TF30 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
WHAMMQ8TF30 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
WHAMMQ8TF30 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
WHAMMQ8TF30 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
WHAMMQ8TF30 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
WHAMMQ8TF30 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
WHAMMQ8TF30 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
WHAMMQ8TF30 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
WHAMMQ8TF30 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
WHAMMQ8TF30 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
WHAMMQ8TF30 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
WHAMMQ8TF30 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
WHAMMQ8TF30 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
WHAMMQ8TF30 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
WHAMMQ8TF30 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
WHAMMQ8TF30 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
WHAMMQ8TF30 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
WHAMMQ8TF30 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
WHAMMQ8TF30 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
WHAMMQ8TF30 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
WHAMMQ8TF30 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
WHAMMQ8TF30 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
WHAMMQ8TF30 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
WHAMMQ8TF30 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
WHAMMQ8TF30 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
WHAMMQ8TF30 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
WHAMMQ8TF30 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
WHAMMQ8TF30 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
WHAMMQ8TF30 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
WHAMMQ8TF30 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
WHAMMQ8TF30 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
WHAMMQ8TF30 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
WHAMMQ8TF30 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
WHAMMQ8TF30 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
WHAMMQ8TF30 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
WHAMMQ8TF30 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
WHAMMQ8TF30 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
WHAMMQ8TF30 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
WHAMMQ8TF30 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
WHAMMQ8TF30 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
WHAMMQ8TF30 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
WHAMMQ8TF30 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
WHAMMQ8TF30 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
WHAMMQ8TF30 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
WHAMMQ8TF30 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
WHAMMQ8TF30 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
WHAMMQ8TF30 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
WHAMMQ8TF30 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
WHAMMQ8TF30 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
WHAMMQ8TF30 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
WHAMMQ8TF30 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
WHAMMQ8TF30 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
WHAMMQ8TF30 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
WHAMMQ8TF30 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
WHAMMQ8TF30 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
WHAMMQ8TF30 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
WHAMMQ8TF30 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
WHAMMQ8TF30 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
WHAMMQ8TF30 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
WHAMMQ8TF30 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
WHAMMQ8TF30 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
WHAMMQ8TF30 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
WHAMMQ8TF30 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
WHAMMQ8TF30 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
WHAMMQ8TF30 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
WHAMMQ8TF30 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
WHAMMQ8TF30 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
WHAMMQ8TF30 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
WHAMMQ8TF30 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
WHAMMQ8TF30 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
WHAMMQ8TF30 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
WHAMMQ8TF30 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
WHAMMQ8TF30 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
WHAMMQ8TF30 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
WHAMMQ8TF30 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
WHAMMQ8TF30 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
WHAMMQ8TF30 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
WHAMMQ8TF30 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
WHAMMQ8TF30 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
WHAMMQ8TF30 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
WHAMMQ8TF30 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
WHAMMQ8TF30 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
WHAMMQ8TF30 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
WHAMMQ8TF30 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
WHAMMQ8TF30 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
WHAMMQ8TF30 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
WHAMMQ8TF30 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
WHAMMQ8TF30 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
WHAMMQ8TF30 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
WHAMMQ8TF30 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
WHAMMQ8TF30 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
WHAMMQ8TF30 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
WHAMMQ8TF30 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
WHAMMQ8TF30 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
WHAMMQ8TF30 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
WHAMMQ8TF30 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
WHAMMQ8TF30 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms