Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDU5

VN1R17P, Putative vomeronasal receptor-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R17PQ8TDU5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VN1R17PQ8TDU5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VN1R17PQ8TDU5 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VN1R17PQ8TDU5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VN1R17PQ8TDU5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VN1R17PQ8TDU5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VN1R17PQ8TDU5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
VN1R17PQ8TDU5 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VN1R17PQ8TDU5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VN1R17PQ8TDU5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VN1R17PQ8TDU5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VN1R17PQ8TDU5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VN1R17PQ8TDU5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VN1R17PQ8TDU5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VN1R17PQ8TDU5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VN1R17PQ8TDU5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VN1R17PQ8TDU5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VN1R17PQ8TDU5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VN1R17PQ8TDU5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VN1R17PQ8TDU5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VN1R17PQ8TDU5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VN1R17PQ8TDU5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VN1R17PQ8TDU5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VN1R17PQ8TDU5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VN1R17PQ8TDU5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VN1R17PQ8TDU5 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VN1R17PQ8TDU5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VN1R17PQ8TDU5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VN1R17PQ8TDU5 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VN1R17PQ8TDU5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VN1R17PQ8TDU5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VN1R17PQ8TDU5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
VN1R17PQ8TDU5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
VN1R17PQ8TDU5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VN1R17PQ8TDU5 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VN1R17PQ8TDU5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VN1R17PQ8TDU5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VN1R17PQ8TDU5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VN1R17PQ8TDU5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VN1R17PQ8TDU5 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VN1R17PQ8TDU5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VN1R17PQ8TDU5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VN1R17PQ8TDU5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VN1R17PQ8TDU5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VN1R17PQ8TDU5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VN1R17PQ8TDU5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VN1R17PQ8TDU5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VN1R17PQ8TDU5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VN1R17PQ8TDU5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VN1R17PQ8TDU5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VN1R17PQ8TDU5 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VN1R17PQ8TDU5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VN1R17PQ8TDU5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VN1R17PQ8TDU5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VN1R17PQ8TDU5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
VN1R17PQ8TDU5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VN1R17PQ8TDU5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VN1R17PQ8TDU5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VN1R17PQ8TDU5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VN1R17PQ8TDU5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VN1R17PQ8TDU5 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
VN1R17PQ8TDU5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VN1R17PQ8TDU5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
VN1R17PQ8TDU5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
VN1R17PQ8TDU5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VN1R17PQ8TDU5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms