Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAV1

PRPF38A, Pre-mRNA-splicing factor 38A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38AQ8NAV1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRPF38AQ8NAV1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRPF38AQ8NAV1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRPF38AQ8NAV1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRPF38AQ8NAV1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRPF38AQ8NAV1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRPF38AQ8NAV1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRPF38AQ8NAV1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRPF38AQ8NAV1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRPF38AQ8NAV1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRPF38AQ8NAV1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRPF38AQ8NAV1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRPF38AQ8NAV1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRPF38AQ8NAV1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRPF38AQ8NAV1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRPF38AQ8NAV1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRPF38AQ8NAV1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRPF38AQ8NAV1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRPF38AQ8NAV1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRPF38AQ8NAV1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRPF38AQ8NAV1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRPF38AQ8NAV1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRPF38AQ8NAV1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PRPF38AQ8NAV1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRPF38AQ8NAV1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRPF38AQ8NAV1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PRPF38AQ8NAV1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRPF38AQ8NAV1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRPF38AQ8NAV1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRPF38AQ8NAV1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRPF38AQ8NAV1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRPF38AQ8NAV1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRPF38AQ8NAV1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRPF38AQ8NAV1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRPF38AQ8NAV1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PRPF38AQ8NAV1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRPF38AQ8NAV1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRPF38AQ8NAV1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRPF38AQ8NAV1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRPF38AQ8NAV1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRPF38AQ8NAV1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRPF38AQ8NAV1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRPF38AQ8NAV1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRPF38AQ8NAV1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRPF38AQ8NAV1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRPF38AQ8NAV1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRPF38AQ8NAV1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRPF38AQ8NAV1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRPF38AQ8NAV1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRPF38AQ8NAV1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRPF38AQ8NAV1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRPF38AQ8NAV1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRPF38AQ8NAV1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRPF38AQ8NAV1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRPF38AQ8NAV1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRPF38AQ8NAV1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PRPF38AQ8NAV1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PRPF38AQ8NAV1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRPF38AQ8NAV1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRPF38AQ8NAV1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRPF38AQ8NAV1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRPF38AQ8NAV1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRPF38AQ8NAV1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRPF38AQ8NAV1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRPF38AQ8NAV1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRPF38AQ8NAV1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRPF38AQ8NAV1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRPF38AQ8NAV1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRPF38AQ8NAV1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRPF38AQ8NAV1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRPF38AQ8NAV1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRPF38AQ8NAV1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRPF38AQ8NAV1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRPF38AQ8NAV1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PRPF38AQ8NAV1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRPF38AQ8NAV1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRPF38AQ8NAV1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRPF38AQ8NAV1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRPF38AQ8NAV1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRPF38AQ8NAV1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRPF38AQ8NAV1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PRPF38AQ8NAV1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRPF38AQ8NAV1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRPF38AQ8NAV1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRPF38AQ8NAV1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRPF38AQ8NAV1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRPF38AQ8NAV1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PRPF38AQ8NAV1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRPF38AQ8NAV1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRPF38AQ8NAV1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRPF38AQ8NAV1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRPF38AQ8NAV1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRPF38AQ8NAV1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRPF38AQ8NAV1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRPF38AQ8NAV1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRPF38AQ8NAV1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRPF38AQ8NAV1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRPF38AQ8NAV1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PRPF38AQ8NAV1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PRPF38AQ8NAV1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms