Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA29

MFSD2A, Sodium-dependent lysophosphatidylcholine symporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD2AQ8NA29 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MFSD2AQ8NA29 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MFSD2AQ8NA29 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MFSD2AQ8NA29 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MFSD2AQ8NA29 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MFSD2AQ8NA29 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MFSD2AQ8NA29 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MFSD2AQ8NA29 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MFSD2AQ8NA29 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MFSD2AQ8NA29 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MFSD2AQ8NA29 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MFSD2AQ8NA29 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MFSD2AQ8NA29 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MFSD2AQ8NA29 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MFSD2AQ8NA29 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MFSD2AQ8NA29 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MFSD2AQ8NA29 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MFSD2AQ8NA29 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MFSD2AQ8NA29 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MFSD2AQ8NA29 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MFSD2AQ8NA29 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MFSD2AQ8NA29 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MFSD2AQ8NA29 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MFSD2AQ8NA29 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MFSD2AQ8NA29 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MFSD2AQ8NA29 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MFSD2AQ8NA29 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MFSD2AQ8NA29 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MFSD2AQ8NA29 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MFSD2AQ8NA29 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MFSD2AQ8NA29 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MFSD2AQ8NA29 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MFSD2AQ8NA29 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MFSD2AQ8NA29 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MFSD2AQ8NA29 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MFSD2AQ8NA29 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MFSD2AQ8NA29 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MFSD2AQ8NA29 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MFSD2AQ8NA29 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MFSD2AQ8NA29 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MFSD2AQ8NA29 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MFSD2AQ8NA29 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MFSD2AQ8NA29 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MFSD2AQ8NA29 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MFSD2AQ8NA29 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MFSD2AQ8NA29 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MFSD2AQ8NA29 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MFSD2AQ8NA29 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MFSD2AQ8NA29 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MFSD2AQ8NA29 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MFSD2AQ8NA29 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MFSD2AQ8NA29 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MFSD2AQ8NA29 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MFSD2AQ8NA29 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MFSD2AQ8NA29 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MFSD2AQ8NA29 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MFSD2AQ8NA29 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MFSD2AQ8NA29 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MFSD2AQ8NA29 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MFSD2AQ8NA29 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MFSD2AQ8NA29 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MFSD2AQ8NA29 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MFSD2AQ8NA29 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MFSD2AQ8NA29 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MFSD2AQ8NA29 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MFSD2AQ8NA29 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MFSD2AQ8NA29 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MFSD2AQ8NA29 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MFSD2AQ8NA29 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MFSD2AQ8NA29 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MFSD2AQ8NA29 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MFSD2AQ8NA29 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MFSD2AQ8NA29 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MFSD2AQ8NA29 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MFSD2AQ8NA29 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MFSD2AQ8NA29 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MFSD2AQ8NA29 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MFSD2AQ8NA29 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MFSD2AQ8NA29 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MFSD2AQ8NA29 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MFSD2AQ8NA29 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MFSD2AQ8NA29 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MFSD2AQ8NA29 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MFSD2AQ8NA29 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MFSD2AQ8NA29 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MFSD2AQ8NA29 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MFSD2AQ8NA29 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MFSD2AQ8NA29 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MFSD2AQ8NA29 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MFSD2AQ8NA29 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
MFSD2AQ8NA29 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MFSD2AQ8NA29 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MFSD2AQ8NA29 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MFSD2AQ8NA29 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MFSD2AQ8NA29 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MFSD2AQ8NA29 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MFSD2AQ8NA29 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MFSD2AQ8NA29 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MFSD2AQ8NA29 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MFSD2AQ8NA29 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms