Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W5

DNAAF3, Dynein assembly factor 3, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF3Q8N9W5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAAF3Q8N9W5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAAF3Q8N9W5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAAF3Q8N9W5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAAF3Q8N9W5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAAF3Q8N9W5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAAF3Q8N9W5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAAF3Q8N9W5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNAAF3Q8N9W5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAAF3Q8N9W5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAAF3Q8N9W5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAAF3Q8N9W5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAAF3Q8N9W5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAAF3Q8N9W5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAAF3Q8N9W5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAAF3Q8N9W5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAAF3Q8N9W5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAAF3Q8N9W5 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNAAF3Q8N9W5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAAF3Q8N9W5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAAF3Q8N9W5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAAF3Q8N9W5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAAF3Q8N9W5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAAF3Q8N9W5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAAF3Q8N9W5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAAF3Q8N9W5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAAF3Q8N9W5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
DNAAF3Q8N9W5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAAF3Q8N9W5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAAF3Q8N9W5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAAF3Q8N9W5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAAF3Q8N9W5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAAF3Q8N9W5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAAF3Q8N9W5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAAF3Q8N9W5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAAF3Q8N9W5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAAF3Q8N9W5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNAAF3Q8N9W5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAAF3Q8N9W5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAAF3Q8N9W5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAAF3Q8N9W5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAAF3Q8N9W5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAAF3Q8N9W5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAAF3Q8N9W5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAAF3Q8N9W5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAAF3Q8N9W5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAAF3Q8N9W5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAAF3Q8N9W5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAAF3Q8N9W5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAAF3Q8N9W5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAAF3Q8N9W5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNAAF3Q8N9W5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNAAF3Q8N9W5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNAAF3Q8N9W5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
DNAAF3Q8N9W5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNAAF3Q8N9W5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
DNAAF3Q8N9W5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
DNAAF3Q8N9W5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNAAF3Q8N9W5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNAAF3Q8N9W5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNAAF3Q8N9W5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNAAF3Q8N9W5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNAAF3Q8N9W5 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNAAF3Q8N9W5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNAAF3Q8N9W5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNAAF3Q8N9W5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNAAF3Q8N9W5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNAAF3Q8N9W5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNAAF3Q8N9W5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNAAF3Q8N9W5 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
DNAAF3Q8N9W5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNAAF3Q8N9W5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNAAF3Q8N9W5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNAAF3Q8N9W5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNAAF3Q8N9W5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNAAF3Q8N9W5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNAAF3Q8N9W5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNAAF3Q8N9W5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNAAF3Q8N9W5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNAAF3Q8N9W5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNAAF3Q8N9W5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNAAF3Q8N9W5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNAAF3Q8N9W5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNAAF3Q8N9W5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
DNAAF3Q8N9W5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
DNAAF3Q8N9W5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
DNAAF3Q8N9W5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
DNAAF3Q8N9W5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNAAF3Q8N9W5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNAAF3Q8N9W5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNAAF3Q8N9W5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNAAF3Q8N9W5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNAAF3Q8N9W5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNAAF3Q8N9W5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNAAF3Q8N9W5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNAAF3Q8N9W5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNAAF3Q8N9W5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNAAF3Q8N9W5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
DNAAF3Q8N9W5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DNAAF3Q8N9W5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.3 ms