Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B8

RASGEF1A, Ras-GEF domain-containing family member 1A, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1AQ8N9B8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RASGEF1AQ8N9B8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RASGEF1AQ8N9B8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RASGEF1AQ8N9B8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RASGEF1AQ8N9B8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RASGEF1AQ8N9B8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RASGEF1AQ8N9B8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RASGEF1AQ8N9B8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RASGEF1AQ8N9B8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RASGEF1AQ8N9B8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RASGEF1AQ8N9B8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RASGEF1AQ8N9B8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RASGEF1AQ8N9B8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RASGEF1AQ8N9B8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RASGEF1AQ8N9B8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RASGEF1AQ8N9B8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RASGEF1AQ8N9B8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RASGEF1AQ8N9B8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RASGEF1AQ8N9B8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RASGEF1AQ8N9B8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RASGEF1AQ8N9B8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RASGEF1AQ8N9B8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RASGEF1AQ8N9B8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RASGEF1AQ8N9B8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RASGEF1AQ8N9B8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RASGEF1AQ8N9B8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RASGEF1AQ8N9B8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RASGEF1AQ8N9B8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RASGEF1AQ8N9B8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RASGEF1AQ8N9B8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RASGEF1AQ8N9B8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RASGEF1AQ8N9B8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RASGEF1AQ8N9B8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RASGEF1AQ8N9B8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RASGEF1AQ8N9B8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RASGEF1AQ8N9B8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RASGEF1AQ8N9B8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RASGEF1AQ8N9B8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RASGEF1AQ8N9B8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RASGEF1AQ8N9B8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RASGEF1AQ8N9B8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RASGEF1AQ8N9B8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RASGEF1AQ8N9B8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RASGEF1AQ8N9B8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RASGEF1AQ8N9B8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RASGEF1AQ8N9B8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RASGEF1AQ8N9B8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RASGEF1AQ8N9B8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RASGEF1AQ8N9B8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RASGEF1AQ8N9B8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RASGEF1AQ8N9B8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RASGEF1AQ8N9B8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RASGEF1AQ8N9B8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RASGEF1AQ8N9B8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RASGEF1AQ8N9B8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RASGEF1AQ8N9B8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RASGEF1AQ8N9B8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RASGEF1AQ8N9B8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RASGEF1AQ8N9B8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RASGEF1AQ8N9B8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RASGEF1AQ8N9B8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RASGEF1AQ8N9B8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RASGEF1AQ8N9B8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RASGEF1AQ8N9B8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RASGEF1AQ8N9B8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RASGEF1AQ8N9B8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RASGEF1AQ8N9B8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RASGEF1AQ8N9B8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RASGEF1AQ8N9B8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RASGEF1AQ8N9B8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RASGEF1AQ8N9B8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RASGEF1AQ8N9B8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RASGEF1AQ8N9B8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RASGEF1AQ8N9B8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RASGEF1AQ8N9B8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RASGEF1AQ8N9B8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RASGEF1AQ8N9B8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RASGEF1AQ8N9B8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RASGEF1AQ8N9B8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RASGEF1AQ8N9B8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RASGEF1AQ8N9B8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RASGEF1AQ8N9B8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RASGEF1AQ8N9B8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RASGEF1AQ8N9B8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RASGEF1AQ8N9B8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RASGEF1AQ8N9B8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RASGEF1AQ8N9B8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RASGEF1AQ8N9B8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RASGEF1AQ8N9B8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RASGEF1AQ8N9B8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RASGEF1AQ8N9B8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RASGEF1AQ8N9B8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RASGEF1AQ8N9B8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RASGEF1AQ8N9B8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RASGEF1AQ8N9B8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RASGEF1AQ8N9B8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RASGEF1AQ8N9B8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RASGEF1AQ8N9B8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RASGEF1AQ8N9B8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RASGEF1AQ8N9B8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
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