Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4B4

FBXO39, F-box only protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO39Q8N4B4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO39Q8N4B4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO39Q8N4B4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO39Q8N4B4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO39Q8N4B4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO39Q8N4B4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO39Q8N4B4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO39Q8N4B4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO39Q8N4B4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO39Q8N4B4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO39Q8N4B4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO39Q8N4B4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO39Q8N4B4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FBXO39Q8N4B4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FBXO39Q8N4B4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO39Q8N4B4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO39Q8N4B4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO39Q8N4B4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO39Q8N4B4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO39Q8N4B4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO39Q8N4B4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO39Q8N4B4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO39Q8N4B4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO39Q8N4B4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO39Q8N4B4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO39Q8N4B4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO39Q8N4B4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO39Q8N4B4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO39Q8N4B4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO39Q8N4B4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO39Q8N4B4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO39Q8N4B4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO39Q8N4B4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO39Q8N4B4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO39Q8N4B4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO39Q8N4B4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO39Q8N4B4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO39Q8N4B4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO39Q8N4B4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO39Q8N4B4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO39Q8N4B4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO39Q8N4B4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO39Q8N4B4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO39Q8N4B4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO39Q8N4B4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO39Q8N4B4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO39Q8N4B4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO39Q8N4B4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO39Q8N4B4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO39Q8N4B4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO39Q8N4B4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO39Q8N4B4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO39Q8N4B4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO39Q8N4B4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO39Q8N4B4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO39Q8N4B4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO39Q8N4B4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO39Q8N4B4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO39Q8N4B4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO39Q8N4B4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO39Q8N4B4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO39Q8N4B4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO39Q8N4B4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO39Q8N4B4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO39Q8N4B4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO39Q8N4B4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO39Q8N4B4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO39Q8N4B4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO39Q8N4B4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO39Q8N4B4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO39Q8N4B4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO39Q8N4B4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO39Q8N4B4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO39Q8N4B4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO39Q8N4B4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO39Q8N4B4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO39Q8N4B4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO39Q8N4B4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO39Q8N4B4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO39Q8N4B4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO39Q8N4B4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO39Q8N4B4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO39Q8N4B4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO39Q8N4B4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO39Q8N4B4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO39Q8N4B4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO39Q8N4B4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO39Q8N4B4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO39Q8N4B4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO39Q8N4B4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO39Q8N4B4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FBXO39Q8N4B4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FBXO39Q8N4B4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FBXO39Q8N4B4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FBXO39Q8N4B4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FBXO39Q8N4B4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FBXO39Q8N4B4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO39Q8N4B4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO39Q8N4B4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO39Q8N4B4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms