Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1G4

LRRC47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC47Q8N1G4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC47Q8N1G4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC47Q8N1G4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC47Q8N1G4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC47Q8N1G4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC47Q8N1G4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC47Q8N1G4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC47Q8N1G4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC47Q8N1G4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC47Q8N1G4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC47Q8N1G4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC47Q8N1G4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC47Q8N1G4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC47Q8N1G4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC47Q8N1G4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC47Q8N1G4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC47Q8N1G4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC47Q8N1G4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC47Q8N1G4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC47Q8N1G4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC47Q8N1G4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRC47Q8N1G4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRC47Q8N1G4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRC47Q8N1G4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRC47Q8N1G4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRC47Q8N1G4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRC47Q8N1G4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRC47Q8N1G4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRC47Q8N1G4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRC47Q8N1G4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRC47Q8N1G4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRC47Q8N1G4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRC47Q8N1G4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRC47Q8N1G4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRC47Q8N1G4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRC47Q8N1G4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRC47Q8N1G4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LRRC47Q8N1G4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC47Q8N1G4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC47Q8N1G4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC47Q8N1G4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC47Q8N1G4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC47Q8N1G4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC47Q8N1G4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC47Q8N1G4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC47Q8N1G4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC47Q8N1G4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC47Q8N1G4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC47Q8N1G4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC47Q8N1G4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC47Q8N1G4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC47Q8N1G4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRC47Q8N1G4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRC47Q8N1G4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRC47Q8N1G4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRC47Q8N1G4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRC47Q8N1G4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRC47Q8N1G4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRC47Q8N1G4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC47Q8N1G4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC47Q8N1G4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC47Q8N1G4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC47Q8N1G4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC47Q8N1G4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC47Q8N1G4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC47Q8N1G4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC47Q8N1G4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC47Q8N1G4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC47Q8N1G4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC47Q8N1G4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC47Q8N1G4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC47Q8N1G4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC47Q8N1G4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC47Q8N1G4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC47Q8N1G4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC47Q8N1G4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC47Q8N1G4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC47Q8N1G4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC47Q8N1G4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC47Q8N1G4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC47Q8N1G4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC47Q8N1G4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC47Q8N1G4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC47Q8N1G4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC47Q8N1G4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRC47Q8N1G4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRC47Q8N1G4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRC47Q8N1G4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRC47Q8N1G4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
LRRC47Q8N1G4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC47Q8N1G4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC47Q8N1G4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC47Q8N1G4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC47Q8N1G4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC47Q8N1G4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC47Q8N1G4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC47Q8N1G4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC47Q8N1G4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC47Q8N1G4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC47Q8N1G4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
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