Protein–RNA interactions for Protein: Q8N158

GPC2, Glypican-2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2Q8N158 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GPC2Q8N158 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
GPC2Q8N158 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GPC2Q8N158 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GPC2Q8N158 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GPC2Q8N158 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GPC2Q8N158 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GPC2Q8N158 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GPC2Q8N158 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GPC2Q8N158 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GPC2Q8N158 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GPC2Q8N158 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GPC2Q8N158 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GPC2Q8N158 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GPC2Q8N158 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
GPC2Q8N158 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GPC2Q8N158 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GPC2Q8N158 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GPC2Q8N158 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GPC2Q8N158 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GPC2Q8N158 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
GPC2Q8N158 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GPC2Q8N158 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GPC2Q8N158 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GPC2Q8N158 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GPC2Q8N158 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
GPC2Q8N158 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
GPC2Q8N158 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GPC2Q8N158 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GPC2Q8N158 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
GPC2Q8N158 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GPC2Q8N158 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GPC2Q8N158 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GPC2Q8N158 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GPC2Q8N158 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GPC2Q8N158 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GPC2Q8N158 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GPC2Q8N158 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GPC2Q8N158 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GPC2Q8N158 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GPC2Q8N158 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GPC2Q8N158 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GPC2Q8N158 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GPC2Q8N158 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GPC2Q8N158 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GPC2Q8N158 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
GPC2Q8N158 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GPC2Q8N158 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GPC2Q8N158 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GPC2Q8N158 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GPC2Q8N158 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GPC2Q8N158 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
GPC2Q8N158 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GPC2Q8N158 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
GPC2Q8N158 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GPC2Q8N158 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
GPC2Q8N158 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GPC2Q8N158 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GPC2Q8N158 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GPC2Q8N158 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GPC2Q8N158 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GPC2Q8N158 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GPC2Q8N158 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GPC2Q8N158 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GPC2Q8N158 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GPC2Q8N158 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GPC2Q8N158 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GPC2Q8N158 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GPC2Q8N158 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GPC2Q8N158 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GPC2Q8N158 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GPC2Q8N158 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GPC2Q8N158 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
GPC2Q8N158 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GPC2Q8N158 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GPC2Q8N158 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GPC2Q8N158 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GPC2Q8N158 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GPC2Q8N158 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GPC2Q8N158 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GPC2Q8N158 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GPC2Q8N158 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GPC2Q8N158 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GPC2Q8N158 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GPC2Q8N158 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GPC2Q8N158 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GPC2Q8N158 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GPC2Q8N158 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GPC2Q8N158 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GPC2Q8N158 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GPC2Q8N158 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GPC2Q8N158 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GPC2Q8N158 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GPC2Q8N158 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GPC2Q8N158 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GPC2Q8N158 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GPC2Q8N158 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GPC2Q8N158 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GPC2Q8N158 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GPC2Q8N158 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms