Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ73

RPUSD2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD2Q8IZ73 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPUSD2Q8IZ73 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPUSD2Q8IZ73 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPUSD2Q8IZ73 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPUSD2Q8IZ73 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPUSD2Q8IZ73 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RPUSD2Q8IZ73 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPUSD2Q8IZ73 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPUSD2Q8IZ73 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPUSD2Q8IZ73 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPUSD2Q8IZ73 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPUSD2Q8IZ73 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPUSD2Q8IZ73 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPUSD2Q8IZ73 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPUSD2Q8IZ73 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPUSD2Q8IZ73 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPUSD2Q8IZ73 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPUSD2Q8IZ73 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPUSD2Q8IZ73 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPUSD2Q8IZ73 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPUSD2Q8IZ73 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPUSD2Q8IZ73 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPUSD2Q8IZ73 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPUSD2Q8IZ73 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPUSD2Q8IZ73 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPUSD2Q8IZ73 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPUSD2Q8IZ73 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPUSD2Q8IZ73 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RPUSD2Q8IZ73 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RPUSD2Q8IZ73 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPUSD2Q8IZ73 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPUSD2Q8IZ73 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPUSD2Q8IZ73 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPUSD2Q8IZ73 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RPUSD2Q8IZ73 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPUSD2Q8IZ73 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPUSD2Q8IZ73 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPUSD2Q8IZ73 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPUSD2Q8IZ73 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPUSD2Q8IZ73 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPUSD2Q8IZ73 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPUSD2Q8IZ73 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPUSD2Q8IZ73 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPUSD2Q8IZ73 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPUSD2Q8IZ73 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPUSD2Q8IZ73 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPUSD2Q8IZ73 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPUSD2Q8IZ73 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPUSD2Q8IZ73 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPUSD2Q8IZ73 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RPUSD2Q8IZ73 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPUSD2Q8IZ73 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RPUSD2Q8IZ73 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPUSD2Q8IZ73 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPUSD2Q8IZ73 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPUSD2Q8IZ73 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPUSD2Q8IZ73 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPUSD2Q8IZ73 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPUSD2Q8IZ73 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPUSD2Q8IZ73 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPUSD2Q8IZ73 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPUSD2Q8IZ73 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPUSD2Q8IZ73 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPUSD2Q8IZ73 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPUSD2Q8IZ73 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPUSD2Q8IZ73 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPUSD2Q8IZ73 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RPUSD2Q8IZ73 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPUSD2Q8IZ73 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPUSD2Q8IZ73 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPUSD2Q8IZ73 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RPUSD2Q8IZ73 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPUSD2Q8IZ73 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPUSD2Q8IZ73 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPUSD2Q8IZ73 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPUSD2Q8IZ73 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPUSD2Q8IZ73 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RPUSD2Q8IZ73 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPUSD2Q8IZ73 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPUSD2Q8IZ73 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPUSD2Q8IZ73 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPUSD2Q8IZ73 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPUSD2Q8IZ73 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPUSD2Q8IZ73 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPUSD2Q8IZ73 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPUSD2Q8IZ73 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPUSD2Q8IZ73 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPUSD2Q8IZ73 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPUSD2Q8IZ73 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPUSD2Q8IZ73 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPUSD2Q8IZ73 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPUSD2Q8IZ73 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPUSD2Q8IZ73 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPUSD2Q8IZ73 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RPUSD2Q8IZ73 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPUSD2Q8IZ73 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPUSD2Q8IZ73 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPUSD2Q8IZ73 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPUSD2Q8IZ73 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPUSD2Q8IZ73 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms