Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDKL3Q8IVW4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDKL3Q8IVW4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDKL3Q8IVW4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
CDKL3Q8IVW4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDKL3Q8IVW4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDKL3Q8IVW4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKL3Q8IVW4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKL3Q8IVW4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKL3Q8IVW4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKL3Q8IVW4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKL3Q8IVW4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKL3Q8IVW4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKL3Q8IVW4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKL3Q8IVW4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKL3Q8IVW4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKL3Q8IVW4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKL3Q8IVW4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKL3Q8IVW4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKL3Q8IVW4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKL3Q8IVW4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKL3Q8IVW4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKL3Q8IVW4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKL3Q8IVW4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKL3Q8IVW4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKL3Q8IVW4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKL3Q8IVW4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKL3Q8IVW4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKL3Q8IVW4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKL3Q8IVW4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKL3Q8IVW4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKL3Q8IVW4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKL3Q8IVW4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKL3Q8IVW4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKL3Q8IVW4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKL3Q8IVW4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKL3Q8IVW4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKL3Q8IVW4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKL3Q8IVW4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKL3Q8IVW4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKL3Q8IVW4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKL3Q8IVW4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKL3Q8IVW4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKL3Q8IVW4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKL3Q8IVW4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKL3Q8IVW4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKL3Q8IVW4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKL3Q8IVW4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKL3Q8IVW4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKL3Q8IVW4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKL3Q8IVW4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKL3Q8IVW4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKL3Q8IVW4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKL3Q8IVW4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKL3Q8IVW4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDKL3Q8IVW4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDKL3Q8IVW4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDKL3Q8IVW4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDKL3Q8IVW4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDKL3Q8IVW4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDKL3Q8IVW4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CDKL3Q8IVW4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDKL3Q8IVW4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CDKL3Q8IVW4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDKL3Q8IVW4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKL3Q8IVW4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKL3Q8IVW4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKL3Q8IVW4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKL3Q8IVW4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKL3Q8IVW4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKL3Q8IVW4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKL3Q8IVW4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKL3Q8IVW4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKL3Q8IVW4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKL3Q8IVW4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKL3Q8IVW4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKL3Q8IVW4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKL3Q8IVW4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKL3Q8IVW4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKL3Q8IVW4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKL3Q8IVW4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKL3Q8IVW4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKL3Q8IVW4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKL3Q8IVW4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKL3Q8IVW4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKL3Q8IVW4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKL3Q8IVW4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKL3Q8IVW4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKL3Q8IVW4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKL3Q8IVW4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKL3Q8IVW4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKL3Q8IVW4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKL3Q8IVW4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKL3Q8IVW4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKL3Q8IVW4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKL3Q8IVW4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKL3Q8IVW4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKL3Q8IVW4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKL3Q8IVW4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKL3Q8IVW4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms