Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC50Q8IVM0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC50Q8IVM0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC50Q8IVM0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC50Q8IVM0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC50Q8IVM0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC50Q8IVM0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC50Q8IVM0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC50Q8IVM0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC50Q8IVM0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC50Q8IVM0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC50Q8IVM0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC50Q8IVM0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC50Q8IVM0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC50Q8IVM0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC50Q8IVM0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC50Q8IVM0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC50Q8IVM0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC50Q8IVM0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC50Q8IVM0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC50Q8IVM0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC50Q8IVM0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC50Q8IVM0 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC50Q8IVM0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC50Q8IVM0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC50Q8IVM0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC50Q8IVM0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC50Q8IVM0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC50Q8IVM0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC50Q8IVM0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC50Q8IVM0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC50Q8IVM0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC50Q8IVM0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC50Q8IVM0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC50Q8IVM0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC50Q8IVM0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC50Q8IVM0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC50Q8IVM0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC50Q8IVM0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC50Q8IVM0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC50Q8IVM0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC50Q8IVM0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC50Q8IVM0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC50Q8IVM0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC50Q8IVM0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC50Q8IVM0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC50Q8IVM0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC50Q8IVM0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC50Q8IVM0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC50Q8IVM0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC50Q8IVM0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC50Q8IVM0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC50Q8IVM0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC50Q8IVM0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC50Q8IVM0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC50Q8IVM0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC50Q8IVM0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC50Q8IVM0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC50Q8IVM0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC50Q8IVM0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC50Q8IVM0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC50Q8IVM0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC50Q8IVM0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC50Q8IVM0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC50Q8IVM0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC50Q8IVM0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC50Q8IVM0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC50Q8IVM0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC50Q8IVM0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC50Q8IVM0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC50Q8IVM0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC50Q8IVM0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC50Q8IVM0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC50Q8IVM0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC50Q8IVM0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC50Q8IVM0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC50Q8IVM0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC50Q8IVM0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC50Q8IVM0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC50Q8IVM0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC50Q8IVM0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC50Q8IVM0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC50Q8IVM0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC50Q8IVM0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC50Q8IVM0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC50Q8IVM0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC50Q8IVM0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC50Q8IVM0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC50Q8IVM0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC50Q8IVM0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC50Q8IVM0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC50Q8IVM0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC50Q8IVM0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC50Q8IVM0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC50Q8IVM0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC50Q8IVM0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC50Q8IVM0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC50Q8IVM0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC50Q8IVM0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC50Q8IVM0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms