Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVH2

FOXP4, Forkhead box protein P4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXP4Q8IVH2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FOXP4Q8IVH2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FOXP4Q8IVH2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FOXP4Q8IVH2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FOXP4Q8IVH2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FOXP4Q8IVH2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOXP4Q8IVH2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOXP4Q8IVH2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOXP4Q8IVH2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOXP4Q8IVH2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOXP4Q8IVH2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOXP4Q8IVH2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOXP4Q8IVH2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOXP4Q8IVH2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOXP4Q8IVH2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOXP4Q8IVH2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOXP4Q8IVH2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOXP4Q8IVH2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXP4Q8IVH2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXP4Q8IVH2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXP4Q8IVH2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXP4Q8IVH2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXP4Q8IVH2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXP4Q8IVH2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXP4Q8IVH2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXP4Q8IVH2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXP4Q8IVH2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXP4Q8IVH2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXP4Q8IVH2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXP4Q8IVH2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXP4Q8IVH2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXP4Q8IVH2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXP4Q8IVH2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXP4Q8IVH2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXP4Q8IVH2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXP4Q8IVH2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXP4Q8IVH2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXP4Q8IVH2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXP4Q8IVH2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXP4Q8IVH2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXP4Q8IVH2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXP4Q8IVH2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FOXP4Q8IVH2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FOXP4Q8IVH2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FOXP4Q8IVH2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FOXP4Q8IVH2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
FOXP4Q8IVH2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FOXP4Q8IVH2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FOXP4Q8IVH2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FOXP4Q8IVH2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
FOXP4Q8IVH2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FOXP4Q8IVH2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FOXP4Q8IVH2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FOXP4Q8IVH2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FOXP4Q8IVH2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FOXP4Q8IVH2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FOXP4Q8IVH2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
FOXP4Q8IVH2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FOXP4Q8IVH2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
FOXP4Q8IVH2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FOXP4Q8IVH2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
FOXP4Q8IVH2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
FOXP4Q8IVH2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
FOXP4Q8IVH2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
FOXP4Q8IVH2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FOXP4Q8IVH2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FOXP4Q8IVH2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FOXP4Q8IVH2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FOXP4Q8IVH2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FOXP4Q8IVH2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FOXP4Q8IVH2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FOXP4Q8IVH2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FOXP4Q8IVH2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FOXP4Q8IVH2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FOXP4Q8IVH2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FOXP4Q8IVH2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FOXP4Q8IVH2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FOXP4Q8IVH2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FOXP4Q8IVH2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FOXP4Q8IVH2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FOXP4Q8IVH2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FOXP4Q8IVH2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FOXP4Q8IVH2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FOXP4Q8IVH2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FOXP4Q8IVH2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FOXP4Q8IVH2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FOXP4Q8IVH2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
FOXP4Q8IVH2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FOXP4Q8IVH2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FOXP4Q8IVH2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FOXP4Q8IVH2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FOXP4Q8IVH2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FOXP4Q8IVH2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FOXP4Q8IVH2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FOXP4Q8IVH2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FOXP4Q8IVH2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FOXP4Q8IVH2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FOXP4Q8IVH2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FOXP4Q8IVH2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FOXP4Q8IVH2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms