Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVF7

FMNL3, Formin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMNL3Q8IVF7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FMNL3Q8IVF7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FMNL3Q8IVF7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FMNL3Q8IVF7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FMNL3Q8IVF7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FMNL3Q8IVF7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FMNL3Q8IVF7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FMNL3Q8IVF7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FMNL3Q8IVF7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FMNL3Q8IVF7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FMNL3Q8IVF7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
FMNL3Q8IVF7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FMNL3Q8IVF7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FMNL3Q8IVF7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FMNL3Q8IVF7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FMNL3Q8IVF7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24■■□□□ 1.43
FMNL3Q8IVF7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FMNL3Q8IVF7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FMNL3Q8IVF7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FMNL3Q8IVF7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FMNL3Q8IVF7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FMNL3Q8IVF7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FMNL3Q8IVF7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FMNL3Q8IVF7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FMNL3Q8IVF7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FMNL3Q8IVF7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FMNL3Q8IVF7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
FMNL3Q8IVF7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FMNL3Q8IVF7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FMNL3Q8IVF7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FMNL3Q8IVF7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FMNL3Q8IVF7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FMNL3Q8IVF7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FMNL3Q8IVF7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FMNL3Q8IVF7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FMNL3Q8IVF7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FMNL3Q8IVF7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FMNL3Q8IVF7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
FMNL3Q8IVF7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
FMNL3Q8IVF7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
FMNL3Q8IVF7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
FMNL3Q8IVF7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FMNL3Q8IVF7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FMNL3Q8IVF7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FMNL3Q8IVF7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FMNL3Q8IVF7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FMNL3Q8IVF7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FMNL3Q8IVF7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FMNL3Q8IVF7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FMNL3Q8IVF7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FMNL3Q8IVF7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FMNL3Q8IVF7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FMNL3Q8IVF7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FMNL3Q8IVF7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FMNL3Q8IVF7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FMNL3Q8IVF7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FMNL3Q8IVF7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FMNL3Q8IVF7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FMNL3Q8IVF7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FMNL3Q8IVF7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FMNL3Q8IVF7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FMNL3Q8IVF7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FMNL3Q8IVF7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FMNL3Q8IVF7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FMNL3Q8IVF7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FMNL3Q8IVF7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FMNL3Q8IVF7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
FMNL3Q8IVF7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FMNL3Q8IVF7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FMNL3Q8IVF7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FMNL3Q8IVF7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FMNL3Q8IVF7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FMNL3Q8IVF7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FMNL3Q8IVF7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FMNL3Q8IVF7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FMNL3Q8IVF7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FMNL3Q8IVF7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
FMNL3Q8IVF7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FMNL3Q8IVF7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FMNL3Q8IVF7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FMNL3Q8IVF7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FMNL3Q8IVF7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FMNL3Q8IVF7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FMNL3Q8IVF7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FMNL3Q8IVF7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FMNL3Q8IVF7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FMNL3Q8IVF7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FMNL3Q8IVF7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
FMNL3Q8IVF7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FMNL3Q8IVF7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FMNL3Q8IVF7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FMNL3Q8IVF7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FMNL3Q8IVF7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FMNL3Q8IVF7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FMNL3Q8IVF7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FMNL3Q8IVF7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FMNL3Q8IVF7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FMNL3Q8IVF7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FMNL3Q8IVF7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FMNL3Q8IVF7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms