Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAB11FIP4Q86YS3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
RAB11FIP4Q86YS3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAB11FIP4Q86YS3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAB11FIP4Q86YS3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAB11FIP4Q86YS3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
RAB11FIP4Q86YS3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAB11FIP4Q86YS3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAB11FIP4Q86YS3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAB11FIP4Q86YS3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAB11FIP4Q86YS3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAB11FIP4Q86YS3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAB11FIP4Q86YS3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB11FIP4Q86YS3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB11FIP4Q86YS3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB11FIP4Q86YS3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB11FIP4Q86YS3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB11FIP4Q86YS3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAB11FIP4Q86YS3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAB11FIP4Q86YS3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAB11FIP4Q86YS3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAB11FIP4Q86YS3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAB11FIP4Q86YS3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAB11FIP4Q86YS3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAB11FIP4Q86YS3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAB11FIP4Q86YS3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAB11FIP4Q86YS3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAB11FIP4Q86YS3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAB11FIP4Q86YS3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAB11FIP4Q86YS3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB11FIP4Q86YS3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB11FIP4Q86YS3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB11FIP4Q86YS3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB11FIP4Q86YS3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB11FIP4Q86YS3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB11FIP4Q86YS3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB11FIP4Q86YS3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB11FIP4Q86YS3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB11FIP4Q86YS3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB11FIP4Q86YS3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB11FIP4Q86YS3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB11FIP4Q86YS3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB11FIP4Q86YS3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB11FIP4Q86YS3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAB11FIP4Q86YS3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAB11FIP4Q86YS3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAB11FIP4Q86YS3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAB11FIP4Q86YS3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAB11FIP4Q86YS3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAB11FIP4Q86YS3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAB11FIP4Q86YS3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAB11FIP4Q86YS3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
RAB11FIP4Q86YS3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAB11FIP4Q86YS3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB11FIP4Q86YS3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB11FIP4Q86YS3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB11FIP4Q86YS3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB11FIP4Q86YS3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB11FIP4Q86YS3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB11FIP4Q86YS3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB11FIP4Q86YS3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB11FIP4Q86YS3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB11FIP4Q86YS3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB11FIP4Q86YS3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB11FIP4Q86YS3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB11FIP4Q86YS3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAB11FIP4Q86YS3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAB11FIP4Q86YS3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAB11FIP4Q86YS3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAB11FIP4Q86YS3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAB11FIP4Q86YS3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAB11FIP4Q86YS3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAB11FIP4Q86YS3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAB11FIP4Q86YS3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAB11FIP4Q86YS3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAB11FIP4Q86YS3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RAB11FIP4Q86YS3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RAB11FIP4Q86YS3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RAB11FIP4Q86YS3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RAB11FIP4Q86YS3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RAB11FIP4Q86YS3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAB11FIP4Q86YS3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAB11FIP4Q86YS3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAB11FIP4Q86YS3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAB11FIP4Q86YS3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAB11FIP4Q86YS3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RAB11FIP4Q86YS3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RAB11FIP4Q86YS3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAB11FIP4Q86YS3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAB11FIP4Q86YS3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RAB11FIP4Q86YS3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAB11FIP4Q86YS3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAB11FIP4Q86YS3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAB11FIP4Q86YS3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAB11FIP4Q86YS3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAB11FIP4Q86YS3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAB11FIP4Q86YS3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms