Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNMB4Q86W47 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNMB4Q86W47 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNMB4Q86W47 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNMB4Q86W47 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNMB4Q86W47 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNMB4Q86W47 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNMB4Q86W47 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNMB4Q86W47 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNMB4Q86W47 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNMB4Q86W47 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNMB4Q86W47 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNMB4Q86W47 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNMB4Q86W47 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNMB4Q86W47 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNMB4Q86W47 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNMB4Q86W47 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNMB4Q86W47 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNMB4Q86W47 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNMB4Q86W47 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNMB4Q86W47 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNMB4Q86W47 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNMB4Q86W47 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNMB4Q86W47 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNMB4Q86W47 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNMB4Q86W47 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNMB4Q86W47 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNMB4Q86W47 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNMB4Q86W47 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNMB4Q86W47 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNMB4Q86W47 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNMB4Q86W47 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNMB4Q86W47 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNMB4Q86W47 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNMB4Q86W47 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNMB4Q86W47 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNMB4Q86W47 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNMB4Q86W47 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNMB4Q86W47 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNMB4Q86W47 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNMB4Q86W47 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNMB4Q86W47 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNMB4Q86W47 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNMB4Q86W47 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNMB4Q86W47 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNMB4Q86W47 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNMB4Q86W47 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNMB4Q86W47 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNMB4Q86W47 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNMB4Q86W47 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNMB4Q86W47 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNMB4Q86W47 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNMB4Q86W47 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNMB4Q86W47 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNMB4Q86W47 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNMB4Q86W47 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNMB4Q86W47 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNMB4Q86W47 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNMB4Q86W47 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNMB4Q86W47 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNMB4Q86W47 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNMB4Q86W47 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNMB4Q86W47 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNMB4Q86W47 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNMB4Q86W47 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNMB4Q86W47 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNMB4Q86W47 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNMB4Q86W47 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNMB4Q86W47 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNMB4Q86W47 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNMB4Q86W47 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNMB4Q86W47 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNMB4Q86W47 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNMB4Q86W47 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNMB4Q86W47 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNMB4Q86W47 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNMB4Q86W47 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNMB4Q86W47 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNMB4Q86W47 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNMB4Q86W47 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNMB4Q86W47 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNMB4Q86W47 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNMB4Q86W47 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNMB4Q86W47 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNMB4Q86W47 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNMB4Q86W47 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNMB4Q86W47 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNMB4Q86W47 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNMB4Q86W47 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNMB4Q86W47 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNMB4Q86W47 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNMB4Q86W47 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNMB4Q86W47 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNMB4Q86W47 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNMB4Q86W47 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNMB4Q86W47 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNMB4Q86W47 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNMB4Q86W47 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNMB4Q86W47 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNMB4Q86W47 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms