Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3V4

UBE3B, Ubiquitin-protein ligase E3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3BQ7Z3V4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
UBE3BQ7Z3V4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
UBE3BQ7Z3V4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
UBE3BQ7Z3V4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
UBE3BQ7Z3V4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
UBE3BQ7Z3V4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
UBE3BQ7Z3V4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
UBE3BQ7Z3V4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
UBE3BQ7Z3V4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
UBE3BQ7Z3V4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
UBE3BQ7Z3V4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
UBE3BQ7Z3V4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
UBE3BQ7Z3V4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
UBE3BQ7Z3V4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
UBE3BQ7Z3V4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
UBE3BQ7Z3V4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
UBE3BQ7Z3V4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
UBE3BQ7Z3V4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
UBE3BQ7Z3V4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
UBE3BQ7Z3V4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
UBE3BQ7Z3V4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
UBE3BQ7Z3V4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
UBE3BQ7Z3V4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
UBE3BQ7Z3V4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
UBE3BQ7Z3V4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
UBE3BQ7Z3V4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
UBE3BQ7Z3V4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
UBE3BQ7Z3V4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
UBE3BQ7Z3V4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
UBE3BQ7Z3V4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
UBE3BQ7Z3V4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
UBE3BQ7Z3V4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
UBE3BQ7Z3V4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
UBE3BQ7Z3V4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
UBE3BQ7Z3V4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
UBE3BQ7Z3V4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
UBE3BQ7Z3V4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
UBE3BQ7Z3V4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
UBE3BQ7Z3V4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
UBE3BQ7Z3V4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
UBE3BQ7Z3V4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
UBE3BQ7Z3V4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
UBE3BQ7Z3V4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
UBE3BQ7Z3V4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
UBE3BQ7Z3V4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
UBE3BQ7Z3V4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
UBE3BQ7Z3V4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
UBE3BQ7Z3V4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
UBE3BQ7Z3V4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
UBE3BQ7Z3V4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
UBE3BQ7Z3V4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
UBE3BQ7Z3V4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
UBE3BQ7Z3V4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
UBE3BQ7Z3V4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
UBE3BQ7Z3V4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
UBE3BQ7Z3V4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
UBE3BQ7Z3V4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
UBE3BQ7Z3V4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
UBE3BQ7Z3V4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
UBE3BQ7Z3V4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
UBE3BQ7Z3V4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
UBE3BQ7Z3V4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
UBE3BQ7Z3V4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
UBE3BQ7Z3V4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
UBE3BQ7Z3V4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
UBE3BQ7Z3V4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
UBE3BQ7Z3V4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
UBE3BQ7Z3V4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
UBE3BQ7Z3V4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
UBE3BQ7Z3V4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
UBE3BQ7Z3V4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
UBE3BQ7Z3V4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
UBE3BQ7Z3V4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
UBE3BQ7Z3V4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
UBE3BQ7Z3V4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
UBE3BQ7Z3V4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
UBE3BQ7Z3V4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
UBE3BQ7Z3V4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
UBE3BQ7Z3V4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
UBE3BQ7Z3V4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
UBE3BQ7Z3V4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
UBE3BQ7Z3V4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
UBE3BQ7Z3V4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
UBE3BQ7Z3V4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
UBE3BQ7Z3V4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
UBE3BQ7Z3V4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
UBE3BQ7Z3V4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
UBE3BQ7Z3V4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
UBE3BQ7Z3V4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
UBE3BQ7Z3V4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
UBE3BQ7Z3V4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
UBE3BQ7Z3V4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
UBE3BQ7Z3V4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
UBE3BQ7Z3V4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
UBE3BQ7Z3V4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
UBE3BQ7Z3V4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
UBE3BQ7Z3V4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
UBE3BQ7Z3V4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
UBE3BQ7Z3V4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
UBE3BQ7Z3V4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms