Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNA2D4Q7Z3S7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNA2D4Q7Z3S7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNA2D4Q7Z3S7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNA2D4Q7Z3S7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNA2D4Q7Z3S7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNA2D4Q7Z3S7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNA2D4Q7Z3S7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNA2D4Q7Z3S7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNA2D4Q7Z3S7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNA2D4Q7Z3S7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNA2D4Q7Z3S7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNA2D4Q7Z3S7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNA2D4Q7Z3S7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNA2D4Q7Z3S7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNA2D4Q7Z3S7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNA2D4Q7Z3S7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNA2D4Q7Z3S7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNA2D4Q7Z3S7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNA2D4Q7Z3S7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNA2D4Q7Z3S7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNA2D4Q7Z3S7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNA2D4Q7Z3S7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNA2D4Q7Z3S7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNA2D4Q7Z3S7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNA2D4Q7Z3S7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNA2D4Q7Z3S7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNA2D4Q7Z3S7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNA2D4Q7Z3S7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNA2D4Q7Z3S7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNA2D4Q7Z3S7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNA2D4Q7Z3S7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNA2D4Q7Z3S7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNA2D4Q7Z3S7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNA2D4Q7Z3S7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNA2D4Q7Z3S7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNA2D4Q7Z3S7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNA2D4Q7Z3S7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNA2D4Q7Z3S7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNA2D4Q7Z3S7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNA2D4Q7Z3S7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNA2D4Q7Z3S7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNA2D4Q7Z3S7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CACNA2D4Q7Z3S7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNA2D4Q7Z3S7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNA2D4Q7Z3S7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNA2D4Q7Z3S7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CACNA2D4Q7Z3S7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNA2D4Q7Z3S7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNA2D4Q7Z3S7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CACNA2D4Q7Z3S7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNA2D4Q7Z3S7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNA2D4Q7Z3S7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNA2D4Q7Z3S7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNA2D4Q7Z3S7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNA2D4Q7Z3S7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNA2D4Q7Z3S7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNA2D4Q7Z3S7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNA2D4Q7Z3S7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNA2D4Q7Z3S7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNA2D4Q7Z3S7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNA2D4Q7Z3S7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNA2D4Q7Z3S7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNA2D4Q7Z3S7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNA2D4Q7Z3S7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CACNA2D4Q7Z3S7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNA2D4Q7Z3S7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNA2D4Q7Z3S7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNA2D4Q7Z3S7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNA2D4Q7Z3S7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNA2D4Q7Z3S7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNA2D4Q7Z3S7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNA2D4Q7Z3S7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNA2D4Q7Z3S7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNA2D4Q7Z3S7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNA2D4Q7Z3S7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNA2D4Q7Z3S7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNA2D4Q7Z3S7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNA2D4Q7Z3S7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNA2D4Q7Z3S7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNA2D4Q7Z3S7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNA2D4Q7Z3S7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNA2D4Q7Z3S7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNA2D4Q7Z3S7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNA2D4Q7Z3S7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNA2D4Q7Z3S7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNA2D4Q7Z3S7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNA2D4Q7Z3S7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNA2D4Q7Z3S7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNA2D4Q7Z3S7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNA2D4Q7Z3S7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNA2D4Q7Z3S7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA2D4Q7Z3S7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms