Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Q1

SLC46A3, Solute carrier family 46 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A3Q7Z3Q1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC46A3Q7Z3Q1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC46A3Q7Z3Q1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC46A3Q7Z3Q1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC46A3Q7Z3Q1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC46A3Q7Z3Q1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC46A3Q7Z3Q1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC46A3Q7Z3Q1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC46A3Q7Z3Q1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC46A3Q7Z3Q1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC46A3Q7Z3Q1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC46A3Q7Z3Q1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC46A3Q7Z3Q1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC46A3Q7Z3Q1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC46A3Q7Z3Q1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC46A3Q7Z3Q1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC46A3Q7Z3Q1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC46A3Q7Z3Q1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC46A3Q7Z3Q1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC46A3Q7Z3Q1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC46A3Q7Z3Q1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC46A3Q7Z3Q1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC46A3Q7Z3Q1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC46A3Q7Z3Q1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC46A3Q7Z3Q1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC46A3Q7Z3Q1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC46A3Q7Z3Q1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC46A3Q7Z3Q1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC46A3Q7Z3Q1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC46A3Q7Z3Q1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC46A3Q7Z3Q1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC46A3Q7Z3Q1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC46A3Q7Z3Q1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC46A3Q7Z3Q1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC46A3Q7Z3Q1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC46A3Q7Z3Q1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC46A3Q7Z3Q1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC46A3Q7Z3Q1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC46A3Q7Z3Q1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC46A3Q7Z3Q1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC46A3Q7Z3Q1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC46A3Q7Z3Q1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC46A3Q7Z3Q1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC46A3Q7Z3Q1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC46A3Q7Z3Q1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC46A3Q7Z3Q1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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