Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT5

SSX7, Protein SSX7, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX7Q7RTT5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SSX7Q7RTT5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSX7Q7RTT5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSX7Q7RTT5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSX7Q7RTT5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSX7Q7RTT5 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SSX7Q7RTT5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSX7Q7RTT5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSX7Q7RTT5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSX7Q7RTT5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SSX7Q7RTT5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSX7Q7RTT5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSX7Q7RTT5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSX7Q7RTT5 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSX7Q7RTT5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SSX7Q7RTT5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSX7Q7RTT5 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSX7Q7RTT5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSX7Q7RTT5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SSX7Q7RTT5 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSX7Q7RTT5 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSX7Q7RTT5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSX7Q7RTT5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSX7Q7RTT5 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSX7Q7RTT5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSX7Q7RTT5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSX7Q7RTT5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SSX7Q7RTT5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSX7Q7RTT5 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSX7Q7RTT5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSX7Q7RTT5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSX7Q7RTT5 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSX7Q7RTT5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSX7Q7RTT5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSX7Q7RTT5 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSX7Q7RTT5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSX7Q7RTT5 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSX7Q7RTT5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SSX7Q7RTT5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSX7Q7RTT5 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSX7Q7RTT5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSX7Q7RTT5 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSX7Q7RTT5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSX7Q7RTT5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSX7Q7RTT5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SSX7Q7RTT5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSX7Q7RTT5 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSX7Q7RTT5 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSX7Q7RTT5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSX7Q7RTT5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSX7Q7RTT5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSX7Q7RTT5 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSX7Q7RTT5 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSX7Q7RTT5 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSX7Q7RTT5 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSX7Q7RTT5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSX7Q7RTT5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SSX7Q7RTT5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSX7Q7RTT5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSX7Q7RTT5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSX7Q7RTT5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSX7Q7RTT5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSX7Q7RTT5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms