Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RUFY3Q7L099 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RUFY3Q7L099 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RUFY3Q7L099 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RUFY3Q7L099 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RUFY3Q7L099 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RUFY3Q7L099 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RUFY3Q7L099 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RUFY3Q7L099 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RUFY3Q7L099 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RUFY3Q7L099 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RUFY3Q7L099 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RUFY3Q7L099 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RUFY3Q7L099 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RUFY3Q7L099 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RUFY3Q7L099 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RUFY3Q7L099 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RUFY3Q7L099 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RUFY3Q7L099 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RUFY3Q7L099 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
RUFY3Q7L099 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
RUFY3Q7L099 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
RUFY3Q7L099 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
RUFY3Q7L099 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
RUFY3Q7L099 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RUFY3Q7L099 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RUFY3Q7L099 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RUFY3Q7L099 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RUFY3Q7L099 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RUFY3Q7L099 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RUFY3Q7L099 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RUFY3Q7L099 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RUFY3Q7L099 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RUFY3Q7L099 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RUFY3Q7L099 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RUFY3Q7L099 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RUFY3Q7L099 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RUFY3Q7L099 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RUFY3Q7L099 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
RUFY3Q7L099 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
RUFY3Q7L099 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
RUFY3Q7L099 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RUFY3Q7L099 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RUFY3Q7L099 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RUFY3Q7L099 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RUFY3Q7L099 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RUFY3Q7L099 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RUFY3Q7L099 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RUFY3Q7L099 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RUFY3Q7L099 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RUFY3Q7L099 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
RUFY3Q7L099 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RUFY3Q7L099 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RUFY3Q7L099 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RUFY3Q7L099 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RUFY3Q7L099 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RUFY3Q7L099 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RUFY3Q7L099 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RUFY3Q7L099 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RUFY3Q7L099 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RUFY3Q7L099 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RUFY3Q7L099 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RUFY3Q7L099 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RUFY3Q7L099 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RUFY3Q7L099 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RUFY3Q7L099 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RUFY3Q7L099 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RUFY3Q7L099 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RUFY3Q7L099 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RUFY3Q7L099 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RUFY3Q7L099 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RUFY3Q7L099 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RUFY3Q7L099 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RUFY3Q7L099 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RUFY3Q7L099 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RUFY3Q7L099 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RUFY3Q7L099 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RUFY3Q7L099 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RUFY3Q7L099 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RUFY3Q7L099 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RUFY3Q7L099 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RUFY3Q7L099 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RUFY3Q7L099 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RUFY3Q7L099 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RUFY3Q7L099 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RUFY3Q7L099 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RUFY3Q7L099 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RUFY3Q7L099 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RUFY3Q7L099 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RUFY3Q7L099 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RUFY3Q7L099 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RUFY3Q7L099 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RUFY3Q7L099 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RUFY3Q7L099 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RUFY3Q7L099 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
RUFY3Q7L099 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RUFY3Q7L099 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RUFY3Q7L099 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
RUFY3Q7L099 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RUFY3Q7L099 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms