Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDZD4Q76G19 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDZD4Q76G19 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDZD4Q76G19 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDZD4Q76G19 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDZD4Q76G19 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDZD4Q76G19 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDZD4Q76G19 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDZD4Q76G19 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDZD4Q76G19 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDZD4Q76G19 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDZD4Q76G19 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDZD4Q76G19 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDZD4Q76G19 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDZD4Q76G19 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDZD4Q76G19 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDZD4Q76G19 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDZD4Q76G19 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDZD4Q76G19 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDZD4Q76G19 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDZD4Q76G19 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDZD4Q76G19 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDZD4Q76G19 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDZD4Q76G19 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDZD4Q76G19 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDZD4Q76G19 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDZD4Q76G19 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDZD4Q76G19 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDZD4Q76G19 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDZD4Q76G19 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDZD4Q76G19 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDZD4Q76G19 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDZD4Q76G19 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDZD4Q76G19 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDZD4Q76G19 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PDZD4Q76G19 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDZD4Q76G19 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDZD4Q76G19 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDZD4Q76G19 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PDZD4Q76G19 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDZD4Q76G19 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDZD4Q76G19 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDZD4Q76G19 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDZD4Q76G19 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDZD4Q76G19 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDZD4Q76G19 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDZD4Q76G19 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDZD4Q76G19 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDZD4Q76G19 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDZD4Q76G19 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDZD4Q76G19 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDZD4Q76G19 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDZD4Q76G19 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDZD4Q76G19 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDZD4Q76G19 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDZD4Q76G19 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDZD4Q76G19 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDZD4Q76G19 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDZD4Q76G19 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDZD4Q76G19 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDZD4Q76G19 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDZD4Q76G19 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDZD4Q76G19 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDZD4Q76G19 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDZD4Q76G19 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDZD4Q76G19 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDZD4Q76G19 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDZD4Q76G19 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDZD4Q76G19 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDZD4Q76G19 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDZD4Q76G19 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDZD4Q76G19 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDZD4Q76G19 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDZD4Q76G19 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDZD4Q76G19 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDZD4Q76G19 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDZD4Q76G19 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDZD4Q76G19 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDZD4Q76G19 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PDZD4Q76G19 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDZD4Q76G19 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDZD4Q76G19 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDZD4Q76G19 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDZD4Q76G19 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDZD4Q76G19 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDZD4Q76G19 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDZD4Q76G19 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDZD4Q76G19 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDZD4Q76G19 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDZD4Q76G19 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDZD4Q76G19 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDZD4Q76G19 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDZD4Q76G19 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDZD4Q76G19 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDZD4Q76G19 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDZD4Q76G19 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDZD4Q76G19 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDZD4Q76G19 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDZD4Q76G19 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDZD4Q76G19 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms