Protein–RNA interactions for Protein: Q71UI9

H2AFV, Histone H2A.V, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFVQ71UI9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
H2AFVQ71UI9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
H2AFVQ71UI9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
H2AFVQ71UI9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
H2AFVQ71UI9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
H2AFVQ71UI9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
H2AFVQ71UI9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
H2AFVQ71UI9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
H2AFVQ71UI9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
H2AFVQ71UI9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
H2AFVQ71UI9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
H2AFVQ71UI9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
H2AFVQ71UI9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
H2AFVQ71UI9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
H2AFVQ71UI9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
H2AFVQ71UI9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
H2AFVQ71UI9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
H2AFVQ71UI9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
H2AFVQ71UI9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
H2AFVQ71UI9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
H2AFVQ71UI9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
H2AFVQ71UI9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
H2AFVQ71UI9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
H2AFVQ71UI9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
H2AFVQ71UI9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
H2AFVQ71UI9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
H2AFVQ71UI9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
H2AFVQ71UI9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
H2AFVQ71UI9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
H2AFVQ71UI9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
H2AFVQ71UI9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
H2AFVQ71UI9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
H2AFVQ71UI9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
H2AFVQ71UI9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
H2AFVQ71UI9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
H2AFVQ71UI9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
H2AFVQ71UI9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
H2AFVQ71UI9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
H2AFVQ71UI9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
H2AFVQ71UI9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
H2AFVQ71UI9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
H2AFVQ71UI9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
H2AFVQ71UI9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
H2AFVQ71UI9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
H2AFVQ71UI9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
H2AFVQ71UI9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
H2AFVQ71UI9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
H2AFVQ71UI9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
H2AFVQ71UI9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
H2AFVQ71UI9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
H2AFVQ71UI9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
H2AFVQ71UI9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
H2AFVQ71UI9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
H2AFVQ71UI9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
H2AFVQ71UI9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
H2AFVQ71UI9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
H2AFVQ71UI9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
H2AFVQ71UI9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
H2AFVQ71UI9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
H2AFVQ71UI9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
H2AFVQ71UI9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
H2AFVQ71UI9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
H2AFVQ71UI9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
H2AFVQ71UI9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
H2AFVQ71UI9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
H2AFVQ71UI9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
H2AFVQ71UI9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
H2AFVQ71UI9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
H2AFVQ71UI9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
H2AFVQ71UI9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
H2AFVQ71UI9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
H2AFVQ71UI9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
H2AFVQ71UI9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
H2AFVQ71UI9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
H2AFVQ71UI9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
H2AFVQ71UI9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
H2AFVQ71UI9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
H2AFVQ71UI9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
H2AFVQ71UI9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
H2AFVQ71UI9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
H2AFVQ71UI9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
H2AFVQ71UI9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
H2AFVQ71UI9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
H2AFVQ71UI9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
H2AFVQ71UI9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
H2AFVQ71UI9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
H2AFVQ71UI9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
H2AFVQ71UI9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
H2AFVQ71UI9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
H2AFVQ71UI9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
H2AFVQ71UI9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
H2AFVQ71UI9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
H2AFVQ71UI9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
H2AFVQ71UI9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
H2AFVQ71UI9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
H2AFVQ71UI9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
H2AFVQ71UI9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
H2AFVQ71UI9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
H2AFVQ71UI9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
H2AFVQ71UI9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms