Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR5

TMEM136, Transmembrane protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM136Q6ZRR5 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM136Q6ZRR5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM136Q6ZRR5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM136Q6ZRR5 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM136Q6ZRR5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMEM136Q6ZRR5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMEM136Q6ZRR5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMEM136Q6ZRR5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMEM136Q6ZRR5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TMEM136Q6ZRR5 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMEM136Q6ZRR5 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMEM136Q6ZRR5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMEM136Q6ZRR5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
TMEM136Q6ZRR5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms