Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRF8

RNF207, RING finger protein 207, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF207Q6ZRF8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF207Q6ZRF8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF207Q6ZRF8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF207Q6ZRF8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF207Q6ZRF8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF207Q6ZRF8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF207Q6ZRF8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF207Q6ZRF8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF207Q6ZRF8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF207Q6ZRF8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF207Q6ZRF8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF207Q6ZRF8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF207Q6ZRF8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF207Q6ZRF8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF207Q6ZRF8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF207Q6ZRF8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF207Q6ZRF8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF207Q6ZRF8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF207Q6ZRF8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF207Q6ZRF8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF207Q6ZRF8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF207Q6ZRF8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF207Q6ZRF8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF207Q6ZRF8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF207Q6ZRF8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF207Q6ZRF8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF207Q6ZRF8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF207Q6ZRF8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF207Q6ZRF8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF207Q6ZRF8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF207Q6ZRF8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RNF207Q6ZRF8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RNF207Q6ZRF8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RNF207Q6ZRF8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RNF207Q6ZRF8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RNF207Q6ZRF8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RNF207Q6ZRF8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RNF207Q6ZRF8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RNF207Q6ZRF8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RNF207Q6ZRF8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF207Q6ZRF8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF207Q6ZRF8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF207Q6ZRF8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF207Q6ZRF8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF207Q6ZRF8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF207Q6ZRF8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF207Q6ZRF8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF207Q6ZRF8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF207Q6ZRF8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF207Q6ZRF8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF207Q6ZRF8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF207Q6ZRF8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF207Q6ZRF8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF207Q6ZRF8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF207Q6ZRF8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF207Q6ZRF8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF207Q6ZRF8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF207Q6ZRF8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF207Q6ZRF8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF207Q6ZRF8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF207Q6ZRF8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF207Q6ZRF8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF207Q6ZRF8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF207Q6ZRF8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF207Q6ZRF8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF207Q6ZRF8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF207Q6ZRF8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF207Q6ZRF8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF207Q6ZRF8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF207Q6ZRF8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF207Q6ZRF8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF207Q6ZRF8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF207Q6ZRF8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF207Q6ZRF8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF207Q6ZRF8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF207Q6ZRF8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF207Q6ZRF8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF207Q6ZRF8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF207Q6ZRF8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF207Q6ZRF8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF207Q6ZRF8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF207Q6ZRF8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF207Q6ZRF8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF207Q6ZRF8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF207Q6ZRF8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF207Q6ZRF8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF207Q6ZRF8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF207Q6ZRF8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF207Q6ZRF8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF207Q6ZRF8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF207Q6ZRF8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF207Q6ZRF8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF207Q6ZRF8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF207Q6ZRF8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF207Q6ZRF8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF207Q6ZRF8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF207Q6ZRF8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF207Q6ZRF8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF207Q6ZRF8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF207Q6ZRF8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms