Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN66

GBP6, Guanylate-binding protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP6Q6ZN66 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GBP6Q6ZN66 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GBP6Q6ZN66 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GBP6Q6ZN66 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GBP6Q6ZN66 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GBP6Q6ZN66 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GBP6Q6ZN66 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GBP6Q6ZN66 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GBP6Q6ZN66 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GBP6Q6ZN66 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GBP6Q6ZN66 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GBP6Q6ZN66 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GBP6Q6ZN66 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GBP6Q6ZN66 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GBP6Q6ZN66 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GBP6Q6ZN66 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GBP6Q6ZN66 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GBP6Q6ZN66 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GBP6Q6ZN66 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GBP6Q6ZN66 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GBP6Q6ZN66 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GBP6Q6ZN66 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GBP6Q6ZN66 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GBP6Q6ZN66 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GBP6Q6ZN66 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GBP6Q6ZN66 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GBP6Q6ZN66 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GBP6Q6ZN66 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GBP6Q6ZN66 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GBP6Q6ZN66 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GBP6Q6ZN66 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GBP6Q6ZN66 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GBP6Q6ZN66 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GBP6Q6ZN66 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GBP6Q6ZN66 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GBP6Q6ZN66 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GBP6Q6ZN66 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GBP6Q6ZN66 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GBP6Q6ZN66 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GBP6Q6ZN66 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GBP6Q6ZN66 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GBP6Q6ZN66 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GBP6Q6ZN66 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GBP6Q6ZN66 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GBP6Q6ZN66 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GBP6Q6ZN66 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GBP6Q6ZN66 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GBP6Q6ZN66 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GBP6Q6ZN66 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GBP6Q6ZN66 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GBP6Q6ZN66 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GBP6Q6ZN66 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GBP6Q6ZN66 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GBP6Q6ZN66 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GBP6Q6ZN66 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GBP6Q6ZN66 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GBP6Q6ZN66 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GBP6Q6ZN66 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GBP6Q6ZN66 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GBP6Q6ZN66 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GBP6Q6ZN66 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GBP6Q6ZN66 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GBP6Q6ZN66 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GBP6Q6ZN66 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GBP6Q6ZN66 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GBP6Q6ZN66 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GBP6Q6ZN66 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GBP6Q6ZN66 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GBP6Q6ZN66 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GBP6Q6ZN66 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GBP6Q6ZN66 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GBP6Q6ZN66 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GBP6Q6ZN66 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GBP6Q6ZN66 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GBP6Q6ZN66 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GBP6Q6ZN66 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GBP6Q6ZN66 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GBP6Q6ZN66 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GBP6Q6ZN66 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GBP6Q6ZN66 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GBP6Q6ZN66 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GBP6Q6ZN66 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GBP6Q6ZN66 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GBP6Q6ZN66 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GBP6Q6ZN66 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GBP6Q6ZN66 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GBP6Q6ZN66 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GBP6Q6ZN66 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GBP6Q6ZN66 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GBP6Q6ZN66 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GBP6Q6ZN66 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GBP6Q6ZN66 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GBP6Q6ZN66 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GBP6Q6ZN66 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GBP6Q6ZN66 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GBP6Q6ZN66 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GBP6Q6ZN66 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GBP6Q6ZN66 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GBP6Q6ZN66 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GBP6Q6ZN66 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms