Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRIG3Q6UXM1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRIG3Q6UXM1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRIG3Q6UXM1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRIG3Q6UXM1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRIG3Q6UXM1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRIG3Q6UXM1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRIG3Q6UXM1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRIG3Q6UXM1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRIG3Q6UXM1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LRIG3Q6UXM1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRIG3Q6UXM1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRIG3Q6UXM1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRIG3Q6UXM1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRIG3Q6UXM1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRIG3Q6UXM1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRIG3Q6UXM1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRIG3Q6UXM1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRIG3Q6UXM1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRIG3Q6UXM1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRIG3Q6UXM1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRIG3Q6UXM1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRIG3Q6UXM1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRIG3Q6UXM1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRIG3Q6UXM1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRIG3Q6UXM1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRIG3Q6UXM1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRIG3Q6UXM1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRIG3Q6UXM1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRIG3Q6UXM1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRIG3Q6UXM1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRIG3Q6UXM1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRIG3Q6UXM1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRIG3Q6UXM1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRIG3Q6UXM1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRIG3Q6UXM1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRIG3Q6UXM1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRIG3Q6UXM1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRIG3Q6UXM1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRIG3Q6UXM1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRIG3Q6UXM1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRIG3Q6UXM1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRIG3Q6UXM1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRIG3Q6UXM1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRIG3Q6UXM1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRIG3Q6UXM1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRIG3Q6UXM1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRIG3Q6UXM1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRIG3Q6UXM1 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRIG3Q6UXM1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRIG3Q6UXM1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRIG3Q6UXM1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRIG3Q6UXM1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LRIG3Q6UXM1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRIG3Q6UXM1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRIG3Q6UXM1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRIG3Q6UXM1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRIG3Q6UXM1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRIG3Q6UXM1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRIG3Q6UXM1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRIG3Q6UXM1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRIG3Q6UXM1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LRIG3Q6UXM1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LRIG3Q6UXM1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRIG3Q6UXM1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRIG3Q6UXM1 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRIG3Q6UXM1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRIG3Q6UXM1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRIG3Q6UXM1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRIG3Q6UXM1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRIG3Q6UXM1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRIG3Q6UXM1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRIG3Q6UXM1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRIG3Q6UXM1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRIG3Q6UXM1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRIG3Q6UXM1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRIG3Q6UXM1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRIG3Q6UXM1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRIG3Q6UXM1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRIG3Q6UXM1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRIG3Q6UXM1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRIG3Q6UXM1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRIG3Q6UXM1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRIG3Q6UXM1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRIG3Q6UXM1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRIG3Q6UXM1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRIG3Q6UXM1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRIG3Q6UXM1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRIG3Q6UXM1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRIG3Q6UXM1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRIG3Q6UXM1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRIG3Q6UXM1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRIG3Q6UXM1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRIG3Q6UXM1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRIG3Q6UXM1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRIG3Q6UXM1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRIG3Q6UXM1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRIG3Q6UXM1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRIG3Q6UXM1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRIG3Q6UXM1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms