Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWU4

C6orf89, Bombesin receptor-activated protein C6orf89, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf89Q6UWU4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C6orf89Q6UWU4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
C6orf89Q6UWU4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C6orf89Q6UWU4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C6orf89Q6UWU4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
C6orf89Q6UWU4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C6orf89Q6UWU4 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C6orf89Q6UWU4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C6orf89Q6UWU4 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C6orf89Q6UWU4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C6orf89Q6UWU4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C6orf89Q6UWU4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C6orf89Q6UWU4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C6orf89Q6UWU4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C6orf89Q6UWU4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C6orf89Q6UWU4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C6orf89Q6UWU4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
C6orf89Q6UWU4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C6orf89Q6UWU4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C6orf89Q6UWU4 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C6orf89Q6UWU4 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C6orf89Q6UWU4 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C6orf89Q6UWU4 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C6orf89Q6UWU4 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C6orf89Q6UWU4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C6orf89Q6UWU4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C6orf89Q6UWU4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C6orf89Q6UWU4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C6orf89Q6UWU4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C6orf89Q6UWU4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C6orf89Q6UWU4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C6orf89Q6UWU4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C6orf89Q6UWU4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C6orf89Q6UWU4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C6orf89Q6UWU4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
C6orf89Q6UWU4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C6orf89Q6UWU4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C6orf89Q6UWU4 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C6orf89Q6UWU4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C6orf89Q6UWU4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C6orf89Q6UWU4 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C6orf89Q6UWU4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C6orf89Q6UWU4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C6orf89Q6UWU4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C6orf89Q6UWU4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C6orf89Q6UWU4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C6orf89Q6UWU4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C6orf89Q6UWU4 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C6orf89Q6UWU4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C6orf89Q6UWU4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C6orf89Q6UWU4 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C6orf89Q6UWU4 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
C6orf89Q6UWU4 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
C6orf89Q6UWU4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C6orf89Q6UWU4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C6orf89Q6UWU4 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C6orf89Q6UWU4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C6orf89Q6UWU4 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C6orf89Q6UWU4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C6orf89Q6UWU4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C6orf89Q6UWU4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C6orf89Q6UWU4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C6orf89Q6UWU4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C6orf89Q6UWU4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C6orf89Q6UWU4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C6orf89Q6UWU4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C6orf89Q6UWU4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C6orf89Q6UWU4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C6orf89Q6UWU4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C6orf89Q6UWU4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C6orf89Q6UWU4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C6orf89Q6UWU4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C6orf89Q6UWU4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C6orf89Q6UWU4 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C6orf89Q6UWU4 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C6orf89Q6UWU4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C6orf89Q6UWU4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C6orf89Q6UWU4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
C6orf89Q6UWU4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C6orf89Q6UWU4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
C6orf89Q6UWU4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C6orf89Q6UWU4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C6orf89Q6UWU4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C6orf89Q6UWU4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C6orf89Q6UWU4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C6orf89Q6UWU4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C6orf89Q6UWU4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C6orf89Q6UWU4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C6orf89Q6UWU4 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C6orf89Q6UWU4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C6orf89Q6UWU4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C6orf89Q6UWU4 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C6orf89Q6UWU4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C6orf89Q6UWU4 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C6orf89Q6UWU4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C6orf89Q6UWU4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C6orf89Q6UWU4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C6orf89Q6UWU4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C6orf89Q6UWU4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C6orf89Q6UWU4 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms