Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWJ1

TMCO3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3Q6UWJ1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMCO3Q6UWJ1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMCO3Q6UWJ1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMCO3Q6UWJ1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMCO3Q6UWJ1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMCO3Q6UWJ1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMCO3Q6UWJ1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TMCO3Q6UWJ1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMCO3Q6UWJ1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMCO3Q6UWJ1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMCO3Q6UWJ1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMCO3Q6UWJ1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMCO3Q6UWJ1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMCO3Q6UWJ1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMCO3Q6UWJ1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMCO3Q6UWJ1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMCO3Q6UWJ1 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMCO3Q6UWJ1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMCO3Q6UWJ1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TMCO3Q6UWJ1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMCO3Q6UWJ1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMCO3Q6UWJ1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMCO3Q6UWJ1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMCO3Q6UWJ1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMCO3Q6UWJ1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMCO3Q6UWJ1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMCO3Q6UWJ1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMCO3Q6UWJ1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TMCO3Q6UWJ1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TMCO3Q6UWJ1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMCO3Q6UWJ1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMCO3Q6UWJ1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMCO3Q6UWJ1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMCO3Q6UWJ1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMCO3Q6UWJ1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMCO3Q6UWJ1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMCO3Q6UWJ1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMCO3Q6UWJ1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMCO3Q6UWJ1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMCO3Q6UWJ1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMCO3Q6UWJ1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMCO3Q6UWJ1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMCO3Q6UWJ1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TMCO3Q6UWJ1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMCO3Q6UWJ1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TMCO3Q6UWJ1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMCO3Q6UWJ1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMCO3Q6UWJ1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMCO3Q6UWJ1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMCO3Q6UWJ1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMCO3Q6UWJ1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMCO3Q6UWJ1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMCO3Q6UWJ1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMCO3Q6UWJ1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMCO3Q6UWJ1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMCO3Q6UWJ1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMCO3Q6UWJ1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMCO3Q6UWJ1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMCO3Q6UWJ1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMCO3Q6UWJ1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMCO3Q6UWJ1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMCO3Q6UWJ1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMCO3Q6UWJ1 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMCO3Q6UWJ1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMCO3Q6UWJ1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMCO3Q6UWJ1 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMCO3Q6UWJ1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMCO3Q6UWJ1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMCO3Q6UWJ1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMCO3Q6UWJ1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMCO3Q6UWJ1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMCO3Q6UWJ1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMCO3Q6UWJ1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMCO3Q6UWJ1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMCO3Q6UWJ1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMCO3Q6UWJ1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMCO3Q6UWJ1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMCO3Q6UWJ1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMCO3Q6UWJ1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMCO3Q6UWJ1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMCO3Q6UWJ1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMCO3Q6UWJ1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMCO3Q6UWJ1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMCO3Q6UWJ1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMCO3Q6UWJ1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMCO3Q6UWJ1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMCO3Q6UWJ1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMCO3Q6UWJ1 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMCO3Q6UWJ1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMCO3Q6UWJ1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TMCO3Q6UWJ1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMCO3Q6UWJ1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMCO3Q6UWJ1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMCO3Q6UWJ1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMCO3Q6UWJ1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMCO3Q6UWJ1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMCO3Q6UWJ1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMCO3Q6UWJ1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMCO3Q6UWJ1 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMCO3Q6UWJ1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms