Protein–RNA interactions for Protein: Q6UVM3

KCNT2, Potassium channel subfamily T member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT2Q6UVM3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNT2Q6UVM3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNT2Q6UVM3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNT2Q6UVM3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNT2Q6UVM3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNT2Q6UVM3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNT2Q6UVM3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNT2Q6UVM3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNT2Q6UVM3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNT2Q6UVM3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNT2Q6UVM3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNT2Q6UVM3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNT2Q6UVM3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNT2Q6UVM3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNT2Q6UVM3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNT2Q6UVM3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNT2Q6UVM3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNT2Q6UVM3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNT2Q6UVM3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNT2Q6UVM3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNT2Q6UVM3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNT2Q6UVM3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNT2Q6UVM3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNT2Q6UVM3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNT2Q6UVM3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNT2Q6UVM3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNT2Q6UVM3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNT2Q6UVM3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNT2Q6UVM3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNT2Q6UVM3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNT2Q6UVM3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNT2Q6UVM3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNT2Q6UVM3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNT2Q6UVM3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNT2Q6UVM3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNT2Q6UVM3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNT2Q6UVM3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNT2Q6UVM3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNT2Q6UVM3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNT2Q6UVM3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNT2Q6UVM3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNT2Q6UVM3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNT2Q6UVM3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNT2Q6UVM3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNT2Q6UVM3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNT2Q6UVM3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KCNT2Q6UVM3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNT2Q6UVM3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KCNT2Q6UVM3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNT2Q6UVM3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KCNT2Q6UVM3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNT2Q6UVM3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
KCNT2Q6UVM3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KCNT2Q6UVM3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
KCNT2Q6UVM3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KCNT2Q6UVM3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNT2Q6UVM3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KCNT2Q6UVM3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KCNT2Q6UVM3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNT2Q6UVM3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KCNT2Q6UVM3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNT2Q6UVM3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KCNT2Q6UVM3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNT2Q6UVM3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNT2Q6UVM3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNT2Q6UVM3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KCNT2Q6UVM3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNT2Q6UVM3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNT2Q6UVM3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNT2Q6UVM3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNT2Q6UVM3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNT2Q6UVM3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNT2Q6UVM3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNT2Q6UVM3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNT2Q6UVM3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNT2Q6UVM3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNT2Q6UVM3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNT2Q6UVM3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNT2Q6UVM3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNT2Q6UVM3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNT2Q6UVM3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNT2Q6UVM3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNT2Q6UVM3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNT2Q6UVM3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNT2Q6UVM3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNT2Q6UVM3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNT2Q6UVM3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNT2Q6UVM3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNT2Q6UVM3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNT2Q6UVM3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNT2Q6UVM3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNT2Q6UVM3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNT2Q6UVM3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNT2Q6UVM3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNT2Q6UVM3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNT2Q6UVM3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNT2Q6UVM3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNT2Q6UVM3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNT2Q6UVM3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNT2Q6UVM3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms