Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SMARCD3Q6STE5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMARCD3Q6STE5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMARCD3Q6STE5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMARCD3Q6STE5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMARCD3Q6STE5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMARCD3Q6STE5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMARCD3Q6STE5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMARCD3Q6STE5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMARCD3Q6STE5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMARCD3Q6STE5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMARCD3Q6STE5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMARCD3Q6STE5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMARCD3Q6STE5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMARCD3Q6STE5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMARCD3Q6STE5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMARCD3Q6STE5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMARCD3Q6STE5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMARCD3Q6STE5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMARCD3Q6STE5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMARCD3Q6STE5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMARCD3Q6STE5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMARCD3Q6STE5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMARCD3Q6STE5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMARCD3Q6STE5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMARCD3Q6STE5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMARCD3Q6STE5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMARCD3Q6STE5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMARCD3Q6STE5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMARCD3Q6STE5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMARCD3Q6STE5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMARCD3Q6STE5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMARCD3Q6STE5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMARCD3Q6STE5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMARCD3Q6STE5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMARCD3Q6STE5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMARCD3Q6STE5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMARCD3Q6STE5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SMARCD3Q6STE5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMARCD3Q6STE5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMARCD3Q6STE5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SMARCD3Q6STE5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMARCD3Q6STE5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMARCD3Q6STE5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMARCD3Q6STE5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMARCD3Q6STE5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMARCD3Q6STE5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMARCD3Q6STE5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMARCD3Q6STE5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMARCD3Q6STE5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMARCD3Q6STE5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMARCD3Q6STE5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMARCD3Q6STE5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMARCD3Q6STE5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMARCD3Q6STE5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMARCD3Q6STE5 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMARCD3Q6STE5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCD3Q6STE5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCD3Q6STE5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCD3Q6STE5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCD3Q6STE5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCD3Q6STE5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCD3Q6STE5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCD3Q6STE5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCD3Q6STE5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCD3Q6STE5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCD3Q6STE5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCD3Q6STE5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCD3Q6STE5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCD3Q6STE5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCD3Q6STE5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCD3Q6STE5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCD3Q6STE5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMARCD3Q6STE5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCD3Q6STE5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCD3Q6STE5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCD3Q6STE5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCD3Q6STE5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCD3Q6STE5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCD3Q6STE5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCD3Q6STE5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCD3Q6STE5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCD3Q6STE5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCD3Q6STE5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCD3Q6STE5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCD3Q6STE5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCD3Q6STE5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCD3Q6STE5 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMARCD3Q6STE5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SMARCD3Q6STE5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SMARCD3Q6STE5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCD3Q6STE5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCD3Q6STE5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCD3Q6STE5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCD3Q6STE5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCD3Q6STE5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCD3Q6STE5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCD3Q6STE5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCD3Q6STE5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCD3Q6STE5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms