Protein–RNA interactions for Protein: Q6QAJ8

TMEM220, Transmembrane protein 220, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM220Q6QAJ8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM220Q6QAJ8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM220Q6QAJ8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM220Q6QAJ8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM220Q6QAJ8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM220Q6QAJ8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM220Q6QAJ8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM220Q6QAJ8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM220Q6QAJ8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM220Q6QAJ8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM220Q6QAJ8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM220Q6QAJ8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM220Q6QAJ8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM220Q6QAJ8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM220Q6QAJ8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM220Q6QAJ8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM220Q6QAJ8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM220Q6QAJ8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM220Q6QAJ8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM220Q6QAJ8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM220Q6QAJ8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM220Q6QAJ8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM220Q6QAJ8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM220Q6QAJ8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM220Q6QAJ8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM220Q6QAJ8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM220Q6QAJ8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM220Q6QAJ8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM220Q6QAJ8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM220Q6QAJ8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM220Q6QAJ8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM220Q6QAJ8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM220Q6QAJ8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM220Q6QAJ8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM220Q6QAJ8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM220Q6QAJ8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM220Q6QAJ8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM220Q6QAJ8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMEM220Q6QAJ8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM220Q6QAJ8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM220Q6QAJ8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM220Q6QAJ8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM220Q6QAJ8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM220Q6QAJ8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM220Q6QAJ8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM220Q6QAJ8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM220Q6QAJ8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM220Q6QAJ8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM220Q6QAJ8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM220Q6QAJ8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM220Q6QAJ8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM220Q6QAJ8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM220Q6QAJ8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM220Q6QAJ8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM220Q6QAJ8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM220Q6QAJ8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM220Q6QAJ8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM220Q6QAJ8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM220Q6QAJ8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM220Q6QAJ8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM220Q6QAJ8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM220Q6QAJ8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM220Q6QAJ8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM220Q6QAJ8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM220Q6QAJ8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM220Q6QAJ8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM220Q6QAJ8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM220Q6QAJ8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM220Q6QAJ8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM220Q6QAJ8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM220Q6QAJ8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM220Q6QAJ8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM220Q6QAJ8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM220Q6QAJ8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM220Q6QAJ8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM220Q6QAJ8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM220Q6QAJ8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM220Q6QAJ8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM220Q6QAJ8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM220Q6QAJ8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM220Q6QAJ8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM220Q6QAJ8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM220Q6QAJ8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM220Q6QAJ8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM220Q6QAJ8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM220Q6QAJ8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM220Q6QAJ8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM220Q6QAJ8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM220Q6QAJ8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM220Q6QAJ8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM220Q6QAJ8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM220Q6QAJ8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM220Q6QAJ8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM220Q6QAJ8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM220Q6QAJ8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM220Q6QAJ8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM220Q6QAJ8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM220Q6QAJ8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM220Q6QAJ8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM220Q6QAJ8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms