Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHR2

ULK3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK3Q6PHR2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ULK3Q6PHR2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ULK3Q6PHR2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ULK3Q6PHR2 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ULK3Q6PHR2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ULK3Q6PHR2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ULK3Q6PHR2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ULK3Q6PHR2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ULK3Q6PHR2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ULK3Q6PHR2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ULK3Q6PHR2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ULK3Q6PHR2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ULK3Q6PHR2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ULK3Q6PHR2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ULK3Q6PHR2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ULK3Q6PHR2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ULK3Q6PHR2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ULK3Q6PHR2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ULK3Q6PHR2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ULK3Q6PHR2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ULK3Q6PHR2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ULK3Q6PHR2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ULK3Q6PHR2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ULK3Q6PHR2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ULK3Q6PHR2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ULK3Q6PHR2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ULK3Q6PHR2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ULK3Q6PHR2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ULK3Q6PHR2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ULK3Q6PHR2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ULK3Q6PHR2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ULK3Q6PHR2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ULK3Q6PHR2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ULK3Q6PHR2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ULK3Q6PHR2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ULK3Q6PHR2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ULK3Q6PHR2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ULK3Q6PHR2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ULK3Q6PHR2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ULK3Q6PHR2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ULK3Q6PHR2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ULK3Q6PHR2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ULK3Q6PHR2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ULK3Q6PHR2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ULK3Q6PHR2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ULK3Q6PHR2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ULK3Q6PHR2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ULK3Q6PHR2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ULK3Q6PHR2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ULK3Q6PHR2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ULK3Q6PHR2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ULK3Q6PHR2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ULK3Q6PHR2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ULK3Q6PHR2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ULK3Q6PHR2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ULK3Q6PHR2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ULK3Q6PHR2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ULK3Q6PHR2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ULK3Q6PHR2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ULK3Q6PHR2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ULK3Q6PHR2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ULK3Q6PHR2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ULK3Q6PHR2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ULK3Q6PHR2 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ULK3Q6PHR2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ULK3Q6PHR2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ULK3Q6PHR2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ULK3Q6PHR2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ULK3Q6PHR2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ULK3Q6PHR2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ULK3Q6PHR2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ULK3Q6PHR2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ULK3Q6PHR2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ULK3Q6PHR2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ULK3Q6PHR2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ULK3Q6PHR2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ULK3Q6PHR2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ULK3Q6PHR2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ULK3Q6PHR2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ULK3Q6PHR2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ULK3Q6PHR2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ULK3Q6PHR2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ULK3Q6PHR2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ULK3Q6PHR2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ULK3Q6PHR2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ULK3Q6PHR2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ULK3Q6PHR2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ULK3Q6PHR2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ULK3Q6PHR2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ULK3Q6PHR2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ULK3Q6PHR2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ULK3Q6PHR2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ULK3Q6PHR2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ULK3Q6PHR2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ULK3Q6PHR2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ULK3Q6PHR2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ULK3Q6PHR2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ULK3Q6PHR2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ULK3Q6PHR2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ULK3Q6PHR2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms