Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVH7

SWSAP1, ATPase SWSAP1, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWSAP1Q6NVH7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SWSAP1Q6NVH7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SWSAP1Q6NVH7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SWSAP1Q6NVH7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SWSAP1Q6NVH7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SWSAP1Q6NVH7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SWSAP1Q6NVH7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SWSAP1Q6NVH7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SWSAP1Q6NVH7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SWSAP1Q6NVH7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SWSAP1Q6NVH7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SWSAP1Q6NVH7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SWSAP1Q6NVH7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SWSAP1Q6NVH7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SWSAP1Q6NVH7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SWSAP1Q6NVH7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SWSAP1Q6NVH7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SWSAP1Q6NVH7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SWSAP1Q6NVH7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SWSAP1Q6NVH7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SWSAP1Q6NVH7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SWSAP1Q6NVH7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SWSAP1Q6NVH7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SWSAP1Q6NVH7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SWSAP1Q6NVH7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SWSAP1Q6NVH7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SWSAP1Q6NVH7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SWSAP1Q6NVH7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SWSAP1Q6NVH7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SWSAP1Q6NVH7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SWSAP1Q6NVH7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SWSAP1Q6NVH7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SWSAP1Q6NVH7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SWSAP1Q6NVH7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SWSAP1Q6NVH7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SWSAP1Q6NVH7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SWSAP1Q6NVH7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SWSAP1Q6NVH7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SWSAP1Q6NVH7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SWSAP1Q6NVH7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SWSAP1Q6NVH7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SWSAP1Q6NVH7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SWSAP1Q6NVH7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SWSAP1Q6NVH7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SWSAP1Q6NVH7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SWSAP1Q6NVH7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SWSAP1Q6NVH7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SWSAP1Q6NVH7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SWSAP1Q6NVH7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SWSAP1Q6NVH7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SWSAP1Q6NVH7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SWSAP1Q6NVH7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SWSAP1Q6NVH7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SWSAP1Q6NVH7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SWSAP1Q6NVH7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SWSAP1Q6NVH7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SWSAP1Q6NVH7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SWSAP1Q6NVH7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SWSAP1Q6NVH7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SWSAP1Q6NVH7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SWSAP1Q6NVH7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SWSAP1Q6NVH7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SWSAP1Q6NVH7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SWSAP1Q6NVH7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SWSAP1Q6NVH7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SWSAP1Q6NVH7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SWSAP1Q6NVH7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SWSAP1Q6NVH7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SWSAP1Q6NVH7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SWSAP1Q6NVH7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SWSAP1Q6NVH7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SWSAP1Q6NVH7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SWSAP1Q6NVH7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SWSAP1Q6NVH7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SWSAP1Q6NVH7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SWSAP1Q6NVH7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SWSAP1Q6NVH7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SWSAP1Q6NVH7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SWSAP1Q6NVH7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SWSAP1Q6NVH7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SWSAP1Q6NVH7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SWSAP1Q6NVH7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SWSAP1Q6NVH7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SWSAP1Q6NVH7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SWSAP1Q6NVH7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SWSAP1Q6NVH7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SWSAP1Q6NVH7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SWSAP1Q6NVH7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SWSAP1Q6NVH7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SWSAP1Q6NVH7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SWSAP1Q6NVH7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SWSAP1Q6NVH7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SWSAP1Q6NVH7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SWSAP1Q6NVH7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SWSAP1Q6NVH7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SWSAP1Q6NVH7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SWSAP1Q6NVH7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SWSAP1Q6NVH7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SWSAP1Q6NVH7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SWSAP1Q6NVH7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms