Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUM9

RETSAT, All-trans-retinol 13,14-reductase, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETSATQ6NUM9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RETSATQ6NUM9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RETSATQ6NUM9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RETSATQ6NUM9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RETSATQ6NUM9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RETSATQ6NUM9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RETSATQ6NUM9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RETSATQ6NUM9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RETSATQ6NUM9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RETSATQ6NUM9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RETSATQ6NUM9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RETSATQ6NUM9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RETSATQ6NUM9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RETSATQ6NUM9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RETSATQ6NUM9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RETSATQ6NUM9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RETSATQ6NUM9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RETSATQ6NUM9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RETSATQ6NUM9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RETSATQ6NUM9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RETSATQ6NUM9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RETSATQ6NUM9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RETSATQ6NUM9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RETSATQ6NUM9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RETSATQ6NUM9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RETSATQ6NUM9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RETSATQ6NUM9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RETSATQ6NUM9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RETSATQ6NUM9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RETSATQ6NUM9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RETSATQ6NUM9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RETSATQ6NUM9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RETSATQ6NUM9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RETSATQ6NUM9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RETSATQ6NUM9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RETSATQ6NUM9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RETSATQ6NUM9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RETSATQ6NUM9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RETSATQ6NUM9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RETSATQ6NUM9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RETSATQ6NUM9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RETSATQ6NUM9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RETSATQ6NUM9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RETSATQ6NUM9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RETSATQ6NUM9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RETSATQ6NUM9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RETSATQ6NUM9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RETSATQ6NUM9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RETSATQ6NUM9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RETSATQ6NUM9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RETSATQ6NUM9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RETSATQ6NUM9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RETSATQ6NUM9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RETSATQ6NUM9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RETSATQ6NUM9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RETSATQ6NUM9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RETSATQ6NUM9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RETSATQ6NUM9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RETSATQ6NUM9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RETSATQ6NUM9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RETSATQ6NUM9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RETSATQ6NUM9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RETSATQ6NUM9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RETSATQ6NUM9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RETSATQ6NUM9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RETSATQ6NUM9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RETSATQ6NUM9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RETSATQ6NUM9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RETSATQ6NUM9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RETSATQ6NUM9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RETSATQ6NUM9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RETSATQ6NUM9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RETSATQ6NUM9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RETSATQ6NUM9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RETSATQ6NUM9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RETSATQ6NUM9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RETSATQ6NUM9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RETSATQ6NUM9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RETSATQ6NUM9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RETSATQ6NUM9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RETSATQ6NUM9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RETSATQ6NUM9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RETSATQ6NUM9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RETSATQ6NUM9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RETSATQ6NUM9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RETSATQ6NUM9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RETSATQ6NUM9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RETSATQ6NUM9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RETSATQ6NUM9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RETSATQ6NUM9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RETSATQ6NUM9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RETSATQ6NUM9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RETSATQ6NUM9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RETSATQ6NUM9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RETSATQ6NUM9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RETSATQ6NUM9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RETSATQ6NUM9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RETSATQ6NUM9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RETSATQ6NUM9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RETSATQ6NUM9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms