Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSX1

CCDC70, Coiled-coil domain-containing protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC70Q6NSX1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC70Q6NSX1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC70Q6NSX1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC70Q6NSX1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC70Q6NSX1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC70Q6NSX1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC70Q6NSX1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC70Q6NSX1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC70Q6NSX1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC70Q6NSX1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC70Q6NSX1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC70Q6NSX1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC70Q6NSX1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC70Q6NSX1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC70Q6NSX1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC70Q6NSX1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC70Q6NSX1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC70Q6NSX1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC70Q6NSX1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC70Q6NSX1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC70Q6NSX1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC70Q6NSX1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC70Q6NSX1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC70Q6NSX1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC70Q6NSX1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC70Q6NSX1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC70Q6NSX1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC70Q6NSX1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC70Q6NSX1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC70Q6NSX1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC70Q6NSX1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC70Q6NSX1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC70Q6NSX1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC70Q6NSX1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC70Q6NSX1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC70Q6NSX1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC70Q6NSX1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC70Q6NSX1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC70Q6NSX1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC70Q6NSX1 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC70Q6NSX1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC70Q6NSX1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC70Q6NSX1 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC70Q6NSX1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC70Q6NSX1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC70Q6NSX1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC70Q6NSX1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC70Q6NSX1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC70Q6NSX1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC70Q6NSX1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC70Q6NSX1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC70Q6NSX1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC70Q6NSX1 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC70Q6NSX1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC70Q6NSX1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC70Q6NSX1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC70Q6NSX1 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC70Q6NSX1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC70Q6NSX1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC70Q6NSX1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC70Q6NSX1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC70Q6NSX1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC70Q6NSX1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC70Q6NSX1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC70Q6NSX1 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC70Q6NSX1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC70Q6NSX1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC70Q6NSX1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC70Q6NSX1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC70Q6NSX1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC70Q6NSX1 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC70Q6NSX1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC70Q6NSX1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC70Q6NSX1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC70Q6NSX1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC70Q6NSX1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC70Q6NSX1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC70Q6NSX1 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC70Q6NSX1 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC70Q6NSX1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC70Q6NSX1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC70Q6NSX1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC70Q6NSX1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC70Q6NSX1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC70Q6NSX1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC70Q6NSX1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC70Q6NSX1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC70Q6NSX1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC70Q6NSX1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC70Q6NSX1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC70Q6NSX1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC70Q6NSX1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC70Q6NSX1 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC70Q6NSX1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC70Q6NSX1 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC70Q6NSX1 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC70Q6NSX1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC70Q6NSX1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC70Q6NSX1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC70Q6NSX1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms