Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC8EQ6NSJ5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC8EQ6NSJ5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC8EQ6NSJ5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC8EQ6NSJ5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC8EQ6NSJ5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC8EQ6NSJ5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC8EQ6NSJ5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC8EQ6NSJ5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC8EQ6NSJ5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC8EQ6NSJ5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC8EQ6NSJ5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRC8EQ6NSJ5 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRC8EQ6NSJ5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC8EQ6NSJ5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC8EQ6NSJ5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC8EQ6NSJ5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC8EQ6NSJ5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC8EQ6NSJ5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC8EQ6NSJ5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC8EQ6NSJ5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC8EQ6NSJ5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC8EQ6NSJ5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC8EQ6NSJ5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC8EQ6NSJ5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC8EQ6NSJ5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC8EQ6NSJ5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC8EQ6NSJ5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC8EQ6NSJ5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC8EQ6NSJ5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC8EQ6NSJ5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC8EQ6NSJ5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC8EQ6NSJ5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC8EQ6NSJ5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC8EQ6NSJ5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC8EQ6NSJ5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC8EQ6NSJ5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC8EQ6NSJ5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC8EQ6NSJ5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC8EQ6NSJ5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC8EQ6NSJ5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC8EQ6NSJ5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC8EQ6NSJ5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC8EQ6NSJ5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC8EQ6NSJ5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC8EQ6NSJ5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC8EQ6NSJ5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC8EQ6NSJ5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC8EQ6NSJ5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC8EQ6NSJ5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC8EQ6NSJ5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC8EQ6NSJ5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC8EQ6NSJ5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC8EQ6NSJ5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC8EQ6NSJ5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC8EQ6NSJ5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC8EQ6NSJ5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC8EQ6NSJ5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC8EQ6NSJ5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC8EQ6NSJ5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC8EQ6NSJ5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC8EQ6NSJ5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC8EQ6NSJ5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC8EQ6NSJ5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC8EQ6NSJ5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC8EQ6NSJ5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC8EQ6NSJ5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC8EQ6NSJ5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC8EQ6NSJ5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC8EQ6NSJ5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC8EQ6NSJ5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC8EQ6NSJ5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC8EQ6NSJ5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC8EQ6NSJ5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC8EQ6NSJ5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRC8EQ6NSJ5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRC8EQ6NSJ5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRC8EQ6NSJ5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRC8EQ6NSJ5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRC8EQ6NSJ5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRC8EQ6NSJ5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRC8EQ6NSJ5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRC8EQ6NSJ5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRC8EQ6NSJ5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC8EQ6NSJ5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC8EQ6NSJ5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC8EQ6NSJ5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC8EQ6NSJ5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC8EQ6NSJ5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC8EQ6NSJ5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC8EQ6NSJ5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC8EQ6NSJ5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC8EQ6NSJ5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC8EQ6NSJ5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC8EQ6NSJ5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms