Protein–RNA interactions for Protein: Q6L9W6

B4GALNT3, Beta-1,4-N-acetylgalactosaminyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4GALNT3Q6L9W6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
B4GALNT3Q6L9W6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
B4GALNT3Q6L9W6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
B4GALNT3Q6L9W6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
B4GALNT3Q6L9W6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
B4GALNT3Q6L9W6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
B4GALNT3Q6L9W6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
B4GALNT3Q6L9W6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
B4GALNT3Q6L9W6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
B4GALNT3Q6L9W6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
B4GALNT3Q6L9W6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
B4GALNT3Q6L9W6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
B4GALNT3Q6L9W6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
B4GALNT3Q6L9W6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
B4GALNT3Q6L9W6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
B4GALNT3Q6L9W6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
B4GALNT3Q6L9W6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
B4GALNT3Q6L9W6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
B4GALNT3Q6L9W6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
B4GALNT3Q6L9W6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
B4GALNT3Q6L9W6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
B4GALNT3Q6L9W6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
B4GALNT3Q6L9W6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
B4GALNT3Q6L9W6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
B4GALNT3Q6L9W6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
B4GALNT3Q6L9W6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
B4GALNT3Q6L9W6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
B4GALNT3Q6L9W6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
B4GALNT3Q6L9W6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
B4GALNT3Q6L9W6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
B4GALNT3Q6L9W6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
B4GALNT3Q6L9W6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
B4GALNT3Q6L9W6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
B4GALNT3Q6L9W6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
B4GALNT3Q6L9W6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
B4GALNT3Q6L9W6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
B4GALNT3Q6L9W6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.16
B4GALNT3Q6L9W6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
B4GALNT3Q6L9W6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
B4GALNT3Q6L9W6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
B4GALNT3Q6L9W6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
B4GALNT3Q6L9W6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
B4GALNT3Q6L9W6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
B4GALNT3Q6L9W6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
B4GALNT3Q6L9W6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
B4GALNT3Q6L9W6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
B4GALNT3Q6L9W6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
B4GALNT3Q6L9W6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
B4GALNT3Q6L9W6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
B4GALNT3Q6L9W6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
B4GALNT3Q6L9W6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
B4GALNT3Q6L9W6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
B4GALNT3Q6L9W6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
B4GALNT3Q6L9W6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
B4GALNT3Q6L9W6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
B4GALNT3Q6L9W6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
B4GALNT3Q6L9W6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
B4GALNT3Q6L9W6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
B4GALNT3Q6L9W6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
B4GALNT3Q6L9W6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
B4GALNT3Q6L9W6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
B4GALNT3Q6L9W6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
B4GALNT3Q6L9W6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
B4GALNT3Q6L9W6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
B4GALNT3Q6L9W6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
B4GALNT3Q6L9W6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
B4GALNT3Q6L9W6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
B4GALNT3Q6L9W6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
B4GALNT3Q6L9W6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
B4GALNT3Q6L9W6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
B4GALNT3Q6L9W6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
B4GALNT3Q6L9W6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
B4GALNT3Q6L9W6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
B4GALNT3Q6L9W6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
B4GALNT3Q6L9W6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
B4GALNT3Q6L9W6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
B4GALNT3Q6L9W6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
B4GALNT3Q6L9W6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
B4GALNT3Q6L9W6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
B4GALNT3Q6L9W6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
B4GALNT3Q6L9W6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
B4GALNT3Q6L9W6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
B4GALNT3Q6L9W6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
B4GALNT3Q6L9W6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
B4GALNT3Q6L9W6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
B4GALNT3Q6L9W6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
B4GALNT3Q6L9W6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
B4GALNT3Q6L9W6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
B4GALNT3Q6L9W6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
B4GALNT3Q6L9W6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
B4GALNT3Q6L9W6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
B4GALNT3Q6L9W6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
B4GALNT3Q6L9W6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
B4GALNT3Q6L9W6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
B4GALNT3Q6L9W6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
B4GALNT3Q6L9W6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
B4GALNT3Q6L9W6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
B4GALNT3Q6L9W6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
B4GALNT3Q6L9W6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
B4GALNT3Q6L9W6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms