Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE5

LCN12, Epididymal-specific lipocalin-12, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN12Q6JVE5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LCN12Q6JVE5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LCN12Q6JVE5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms